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Enregistrement W3164773381 · doi:10.21203/rs.3.rs-115227/v1

Nucleocytoplasmic Transport of RNA-Binding Proteins Regulates Neural Stem Cell Fates 

2020· preprint· en· W3164773381 sur OpenAlexafffund
Melissa J MacPherson, Sarah L. Erickson, Drayden Kopp, Pengqiang Wen, Mohammadreza Aghanoori, Antonio Vitobello, Quentin Thomas, Nina B. Gold, William Brucker, Louise Amlie‐Wolf, Karen W. Gripp, Olaf A. Bodamer, Laurence Faivre, Mikko Muona, Xing‐Chang Wei, Quan Long, A. Micheil Innes, Guang Yang

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCell fate determinationNeural stem cellBiologyProgenitor cellCell biologyNeural cellNeurogenesisRNA-binding proteinProgenitorCellular differentiationRNANeural developmentCellStem cellTranscription factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The formation of the cerebral cortex requires balanced expansion and differentiation of neural progenitor cells, the fate choice of which requires regulation at many steps of gene expression. As progenitor cells often exhibit transcriptomic stochasticity, the ultimate output of cell fate-determining genes must be carefully controlled at the post-transcriptional level, but how this is orchestrated is poorly understood. Here we report that de novo missense variants in an RNA-binding protein CELF2 cause human cortical malformations and perturb neural progenitor cell fate decisions in mice by disrupting the nucleocytoplasmic transport of CELF2. In self-renewing neural progenitors, CELF2 is localized in the cytoplasm where it binds and coordinates mRNAs that encode cell fate regulators and neurodevelopmental disorder-related factors. The translocation of CELF2 into the nucleus releases mRNAs for translation and thereby triggers neural progenitor differentiation. Our results reveal a mechanism by which transport of CELF2 between discrete subcellular compartments orchestrates an RNA regulon to instruct cell fates in cerebral cortical development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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