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Enregistrement W3164796529 · doi:10.1111/sji.13050

Exploring the role of the multiple sclerosis susceptibility gene <i>CLEC16A</i> in T cells

2021· article· en· W3164796529 sur OpenAlexfundno aff
Anna Maria Eriksson, Ingvild Sørum Leikfoss, Greger Abrahamsen, Vibeke Sundvold, Martine Mesel Isom, Pankaj Keshari, Torbjørn Rognes, Ole J.B. Landsverk, Steffan D. Bos, Hanne F. Harbo, Anne Spurkland, Tone Berge

Notice bibliographique

RevueScandinavian Journal of Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHelse Sør-Øst RHFNovartis Pharmaceuticals CanadaNorges ForskningsrådWellcome Trust
Mots-clésJurkat cellsBiologyFlow cytometryT cellCell biologyImmune systemImmunologyCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract C‐type lectin‐like domain family 16 member A ( CLEC16A ) is associated with autoimmune disorders, including multiple sclerosis (MS), but its functional relevance is not completely understood. CLEC16A is expressed in several immune cells, where it affects autophagic processes and receptor expression. Recently, we reported that the risk genotype of an MS‐associated single nucleotide polymorphism in CLEC16A intron 19 is associated with higher expression of CLEC16A in CD4 + T cells. Here, we show that CLEC16A expression is induced in CD4 + T cells upon T cell activation. By the use of imaging flow cytometry and confocal microscopy, we demonstrate that CLEC16A is located in Rab4a‐positive recycling endosomes in Jurkat TAg T cells. CLEC16A knock‐down in Jurkat cells resulted in lower cell surface expression of the T cell receptor, however, this did not have a major impact on T cell activation response in vitro in Jurkat nor in human, primary CD4 + T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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