Plasma microRNAs are associated with domain-specific cognitive function in people with HIV
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Cognitive impairment remains common in people with HIV (PWH) on antiretroviral therapy (ART). The clinical presentation and severity are highly variable in PWH suggesting that the pathophysiological mechanisms of cognitive complications are likely complex and multifactorial. MicroRNA (miRNA) expression changes may be linked to cognition as they are gene regulators involved in immune and stress responses as well as the development, plasticity, and differentiation of neurons. We examined plasma miRNA expression changes in relation to domain-specific and global cognitive function in PWH. DESIGN: Cross-sectional observational study. METHODS: Thirty-three PWH receiving care at the Southern Alberta Clinic, Canada completed neuropsychological (NP) testing and blood draw. Plasma miRNA extraction was followed by array hybridization. Random forest analysis was used to identify the top 10 miRNAs upregulated and downregulated in relation to cognition. RESULTS: Few miRNAs were identified across cognitive domains; however, when evident a miRNA was only associated with two or three domains. Notably, miR-127-3p was related to learning/memory and miR-485-5p to motor function, miRNAs previously identified in CSF or plasma in Alzheimer's and Parkinson's, respectively. Using miRNET 2.0, a software-platform for understanding the biological relevance of the miRNA-targets (genes) relating to cognition through a network-based approach, we identified genes involved in signaling, cell cycle, and transcription relating to executive function, learning/memory, and language. CONCLUSION: Findings support the idea that evaluating miRNA expression (or any molecular measure) in the context of global NP function might exclude miRNAs that could be important contributors to the domain-specific mechanisms leading to the variable neuropsychiatric outcomes seen in PWH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».