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Enregistrement W3164910662 · doi:10.1016/j.ijid.2021.05.011

A simplified alternative diagnostic algorithm for SARS-CoV-2 suspected symptomatic patients and confirmed close contacts (asymptomatic): A consensus of Latin American experts

2021· article· en· W3164910662 sur OpenAlexaboutno aff
Fabián Fay, Carlos Álvarez, Pablo Bonvehí, Carolina Cucho-Espinoza, Marco Luis Herrera Hidalgo, Marcel Marcano-Lozada, Carlos M. Pérez, Álvaro Pulchinelli, Klever V Sáenz-Flor, Antônio Condino‐Neto

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRoche
Mots-clésAsymptomaticMedicineLatin AmericansPandemicAlgorithmCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Diagnostic testSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Test (biology)Quarter (Canadian coin)Family medicineIntensive care medicinePediatricsComputer sciencePathologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)Political scienceGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Latin America accounts for one-quarter of global COVID-19 cases and one-third of deaths. Inequalities in the region lead to barriers to the best use of diagnostic tests during the pandemic. There is a need for simplified guidelines that consider the region's limited health resources, international guidelines, medical literature, and local expertise. METHODS: Using a modified Delphi method, 9 experts from Latin American countries developed a simplified algorithm for COVID-19 diagnosis on the basis of their answers to 24 questions related to diagnostic settings, and discussion of the literature and their experiences. RESULTS: The algorithm considers 3 timeframes (≤7 days, 8-13 days, and ≥14 days) and presents diagnostic options for each. SARS-CoV-2 real- time reverse transcription-polymerase chain reaction is the test of choice from day 1 to 14 after symptom onset or close contact, although antigen testing may be used in specific circumstances, from day 5 to 7. Antibody assays may be used for confirmation, usually after day 14; however, if clinical suspicion is very high, but other tests are negative, these assays may be used as an adjunct to decision-making from day 8 to 13. CONCLUSION: The proposed algorithm aims to support COVID-19 diagnosis decision-making in Latin America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,044
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,044
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0060,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0040,005
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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