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Enregistrement W3164979178 · doi:10.1016/j.jclinepi.2021.05.007

PRIME-IPD SERIES Part 1. The PRIME-IPD tool promoted verification and standardization of study datasets retrieved for IPD meta-analysis

2021· article· en· W3164979178 sur OpenAlexafffund
Omar Dewidar, Alison Riddle, Elizabeth Tanjong Ghogomu, Alomgir Hossain, Paul Arora, Zulfiqar A Bhutta, Robert E. Black, Simon Cousens, Michelle F Gaffey, Christine Mathew, Jessica Trawin, Peter Tugwell, Vivian Welch, George A. Wells

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Epidemiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensOttawa HospitalCentre for Global Health ResearchUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenBruyèreUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenBruyère Research InstituteBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésStandardizationComputer scienceMeta-analysisPrime (order theory)Data miningMissing dataData qualityArtificial intelligenceMachine learningMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: We describe a systematic approach to preparing data in the conduct of Individual Participant Data (IPD) analysis. STUDY DESIGN AND SETTING: A guidance paper proposing methods for preparing individual participant data for meta-analysis from multiple study sources, developed by consultation of relevant guidance and experts in IPD. We present an example of how these steps were applied in checking data for our own IPD meta analysis (IPD-MA). RESULTS: We propose five steps of Processing, Replication, Imputation, Merging, and Evaluation to prepare individual participant data for meta-analysis (PRIME-IPD). Using our own IPD-MA as an exemplar, we found that this approach identified missing variables and potential inconsistencies in the data, facilitated the standardization of indicators across studies, confirmed that the correct data were received from investigators, and resulted in a single, verified dataset for IPD-MA. CONCLUSION: The PRIME-IPD approach can assist researchers to systematically prepare, manage and conduct important quality checks on IPD from multiple studies for meta-analyses. Further testing of this framework in IPD-MA would be useful to refine these steps.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarecherche
Domaine: Reproductibilité · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelhigh
gptMétarecherche
Domaine: Méthodes · Genre: Méthodes
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Autre devishigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,426
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,690
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,574
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,4260,690
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,008
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,015
Bibliométrie0,0210,017
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0120,013
Science ouverte0,0080,020
Intégrité de la recherche0,0060,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0670,018

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,942
Tête enseignante GPT0,683
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Métarecherche

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeObservationnel · Autre devis
DomaineReproductibilité · Méthodes
GenreEmpirique · Méthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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