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Enregistrement W3165011493 · doi:10.1101/2021.05.31.21257841

Aerosol SARS-CoV-2 in hospitals and long-term care homes during the COVID-19 pandemic

2021· preprint· en· W3165011493 sur OpenAlexafffund
Gary Mallach, Samantha B. Kasloff, Anand Kumar, Ryan Kulka, Jay Krishnan, Benoît Robert, Michaeline McGuinty, Sophia den Otter-Moore, Bashour Yazji, Todd Cutts

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfection Control and Ventilation
Établissements canadiensQueen's UniversityChildren's Hospital of Eastern OntarioOttawa HospitalHealth CanadaUniversity of ManitobaPublic Health Agency of CanadaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHealth CanadaPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésOutbreakAerosolCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Airborne transmissionSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Veterinary medicineMedicinePandemicEnvironmental scienceAerosolizationVirologyMeteorologyInhalationGeographyInfectious disease (medical specialty)Internal medicineAnesthesia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Few studies have quantified aerosol concentrations of SARS-CoV-2 in hospitals and long-term care homes, and fewer still have examined samples for viability. This information is needed to clarify transmission risks beyond close contact. Methods We deployed particulate air samplers in rooms with COVID-19 positive patients in hospital ward and ICU rooms, rooms in long-term care homes experiencing outbreaks, and a correctional facility experiencing an outbreak. Samplers were placed between 2 and 3 meters from the patient. Aerosol (small liquid particles suspended in air) samples were collected onto gelatin filters by Ultrasonic Personal Air Samplers (UPAS) fitted with <2.5µm (micrometer) and <10 µm size-selective inlets operated for 16 hours (total 1.92m 3 ), and with a Coriolis Biosampler over 10 minutes (total 1.5m 3 ). Samples were assayed for viable SARS-CoV-2 virus and for the viral genome by multiplex PCR using the E and N protein target sequences. We validated the sampling methods by inoculating gelatin filters with viable vesicular stomatitis virus (VSV), and with three concentrations of viable SARS-CoV-2, operating personal samplers for 16hrs, and quantifying viable virus recovery by TCID 50 assay. Results In total, 138 samples were collected from 99 rooms. RNA samples were positive in 9.1% (6/66) of samples obtained with the UPAS 2.5µm samplers, 13.5% (7/52) with the UPAS 10µm samplers, and 10.0% (2/20) samples obtained with the Coriolis samplers. Culturable virus was not recovered in any samples. Viral RNA was detected in 10.9% of the rooms sampled. There was no significant difference in viral RNA recovery between the different room locations or samplers. Method development experiments indicated minimal loss of SARS-CoV-2 viability via the personal air sampler operation. Key Findings Although a subset of aerosol samples exhibited detectable SARS-CoV-2 RNA at low titres, the presence of viable SARS-CoV-2 virus in aerosols appears to be infrequent at >2m distance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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