Anaerobic Benzene Biodegradation Linked to the Growth of Highly Specific Bacterial Clades
Notice bibliographique
Résumé
Reliance on bioremediation to remove benzene from anoxic environments has proven risky for decades but for unknown reasons. Research has revealed a strong link between anaerobic benzene biodegradation and the enrichment of highly specific microbes, including Thermincola in the family Peptococcaceae and the deltaproteobacterial Candidate Sva0485 clade. Using aquifer materials from Canadian Forces Base Borden, we compared five bioremediation approaches in batch microcosms. Under conditions simulating natural attenuation or sulfate biostimulation, benzene was not degraded after 1–2 years of incubation and no enrichment of known benzene-degrading microbes occurred. In contrast, nitrate-amended microcosms reported benzene biodegradation coincident with significant growth of Thermincola spp., along with a functional gene presumed to catalyze anaerobic benzene carboxylation ( abcA ). Inoculation with 2.5% of a methanogenic benzene-degrading consortium containing Sva0485 ( Deltaproteobacteria ORM2) resulted in benzene biodegradation in the presence of sulfate or under methanogenic conditions. The presence of other hydrocarbon co-contaminants decreased the rates of benzene degradation by a factor of 2 to 4. Tracking the abundance of the abcA gene and 16S rRNA genes specific for benzene-degrading Thermincola and Sva0485 is recommended to monitor benzene bioremediation in anoxic groundwater systems to further uncover growth-rate-limiting conditions for these two intriguing phylotypes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».