N6-methyladenosine RNA modification regulates strawberry fruit ripening in an ABA-dependent manner
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Epigenetic mark such as DNA methylation plays pivotal roles in regulating ripening of both climacteric and non-climacteric fruits. However, it remains unclear whether mRNA m 6 A methylation, which has been shown to regulate ripening of the tomato, a typical climacteric fruit, is functionally conserved for ripening control among different types of fruits. Results Here we show that m 6 A methylation displays a dramatic change at ripening onset of strawberry, a classical non-climacteric fruit. The m 6 A modification in coding sequence (CDS) regions appears to be ripening-specific and tends to stabilize the mRNAs, whereas m 6 A around the stop codons and within the 3′ untranslated regions is generally negatively correlated with the abundance of associated mRNAs. We identified thousands of transcripts with m 6 A hypermethylation in the CDS regions, including those of NCED5 , ABAR , and AREB1 in the abscisic acid (ABA) biosynthesis and signaling pathway. We demonstrate that the methyltransferases MTA and MTB are indispensable for normal ripening of strawberry fruit, and MTA-mediated m 6 A modification promotes mRNA stability of NCED5 and AREB1 , while facilitating translation of ABAR . Conclusion Our findings uncover that m 6 A methylation regulates ripening of the non-climacteric strawberry fruit by targeting the ABA pathway, which is distinct from that in the climacteric tomato fruit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».