The N-terminal and central domains of CoV-2 nsp1 play key functional roles in suppression of cellular gene expression and preservation of viral gene expression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Nonstructural protein 1 (nsp1) is the first viral protein synthesized during coronavirus (CoV) infection and is a key virulence factor that dampens the innate immune response. It restricts cellular gene expression through a combination of inhibiting translation by blocking the mRNA entry channel of the 40S ribosomal subunit and by promoting mRNA degradation. We performed a detailed structure-guided mutational analysis of CoV-2 nsp1 coupled with in vitro and cell-based functional assays, revealing insight into how it coordinates these activities against host but not viral mRNA. We found that residues in the N-terminal and central regions of nsp1 not involved in docking into the 40S mRNA entry channel nonetheless stabilize its association with the ribosome and mRNA, thereby enhancing its restriction of host gene expression. These residues are also critical for the ability of mRNA containing the CoV-2 leader sequence to escape translational repression. Notably, we identify CoV-2 nsp1 mutants that gain the ability to repress translation of viral leader-containing transcripts. These data support a model in which viral mRNA binding functionally alters the association of nsp1 with the ribosome, which has implications for drug targeting and understanding how engineered or emerging mutations in CoV-2 nsp1 could attenuate the virus.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».