Analysis of area of intergradation between described subspecies of the common garter snake, Thamnophis sirtalis, in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Two area of colour pattern intergradation have been described between subspecies of the garter snake, 'Thamnophis sirtalis': one along the Manitoba/Ontario border; the other through Quebec and the New England states. Two competing hypotheses have been proposed for the origins of these areas. The first is that these areas represent regions of postglacial secondary contact between two dispersing lineages of snake. The other is that these regions represent 'in situ' differentiation of colour pattern, perhaps in response to some form of natural selection. The strict consensus tree constructed from a 364 bp portion of cytochrome ' b' sequenced from 52 snakes (24 trees, 85 steps, CI = 0.76, RI = 0.93, RC = 0.71) shows that three distinct mtDNA lineages of 'T. sirtalis ' recolonized central and eastern Canada. A "western" lineage is found in Manitoba and northeastern Ontario, an "eastern" lineage is found in northeastern and southern Ontario and in parts of Quebec and New York, and a "maritime" lineage is found in the maritime provinces and parts of the northeastern United States. The geographical regions where the various lineages meet do not correspond to the geographical position of the area of colour pattern intergradation (p < 10-17). Analysis of allozyme variation reveals considerable population substructuring (overall loci FST = 0.259) which is concordant with the distribution of mtDNA lineages. A meristic character, the number of ventral scales, also varies significantly with sex and haplotype. There is no evidence of male-biased gene flow between any of the lineages, therefore the areas of colour pattern intergradation were likely formed 'in situ'. One area of postglacial secondary contact was identified along the northern shore of Lake Superior, just east of Terrace Bay, Ontario. Neutral introgression can not be rejected as an explanation for the pattern of genetic variation observed at this area of secondary contact.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».