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Enregistrement W3165747741 · doi:10.1038/s41436-021-01196-9

Biallelic and monoallelic variants in PLXNA1 are implicated in a novel neurodevelopmental disorder with variable cerebral and eye anomalies

2021· article· en· W3165747741 sur OpenAlexaff
Gabriel C. Dworschak, Jaya Punetha, Jeshurun C. Kalanithy, Enrico Mingardo, Haktan Bağış Erdem, Zeynep Coban‐Akdemir, Ender Karaca, Tadahiro Mitani, Dana Marafi, Jawid M. Fatih, Shalini N. Jhangiani, Jill V. Hunter, Tikam Chand Dakal, Bhanupriya Dhabhai, Omar Dabbagh, Hessa S. Alsaif, Fowzan S. Alkuraya, Reza Maroofian, Henry Houlden, Stéphanie Efthymiou, Natalia Dominik, Vincenzo Salpietro, Tipu Sultan, Shahzad Haider, Farah Bibi, Hölger Thiele, Julia Hoefele, Korbinian M. Riedhammer, Matias Wagner, Ilaria Guella, Michelle Demos, Boris Keren, Julien Buratti, Perrine Charles, Caroline Nava, Delphine Héron, Solveig Heide, Elise Valkanas, Leigh B. Waddell, Kristi Jones, Emily C. Oates, Sandra T. Cooper, Daniel G. MacArthur, Steffen Syrbe, Andreas Ziegler, Konrad Platzer, Volkan Okur, Wendy K. Chung, Sarah A. O’Shea, Roy N. Alcalay, Stanley Fahn, Paul R. Mark, Renzo Guerrini, Annalisa Vetro, Beth Hudson, Rhonda E. Schnur, George Hoganson, Jennifer Burton, Meriel McEntagart, Tobias Lindenberg, Öznur Yılmaz, Benjamin Odermatt, Davut Pehli̇van, Jennifer E. Posey, James R. Lupski, Heiko Reutter

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Human Genome Research InstituteDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Center for Advancing Translational SciencesRosetrees TrustWellcome Trust
Mots-clésZebrafishPlexinPhenotypeBiologyGeneticsMissense mutationNeurodevelopmental disorderPenetranceReceptorGeneSemaphorin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To investigate the effect of PLXNA1 variants on the phenotype of patients with autosomal dominant and recessive inheritance patterns and to functionally characterize the zebrafish homologs plxna1a and plxna1b during development. METHODS: We assembled ten patients from seven families with biallelic or de novo PLXNA1 variants. We describe genotype-phenotype correlations, investigated the variants by structural modeling, and used Morpholino knockdown experiments in zebrafish to characterize the embryonic role of plxna1a and plxna1b. RESULTS: Shared phenotypic features among patients include global developmental delay (9/10), brain anomalies (6/10), and eye anomalies (7/10). Notably, seizures were predominantly reported in patients with monoallelic variants. Structural modeling of missense variants in PLXNA1 suggests distortion in the native protein. Our zebrafish studies enforce an embryonic role of plxna1a and plxna1b in the development of the central nervous system and the eye. CONCLUSION: We propose that different biallelic and monoallelic variants in PLXNA1 result in a novel neurodevelopmental syndrome mainly comprising developmental delay, brain, and eye anomalies. We hypothesize that biallelic variants in the extracellular Plexin-A1 domains lead to impaired dimerization or lack of receptor molecules, whereas monoallelic variants in the intracellular Plexin-A1 domains might impair downstream signaling through a dominant-negative effect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,413
Score d'incertitude au seuil0,630

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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