Validating Star-Oddi heart rate and acceleration data storage tags for use in Atlantic salmon (Salmo salar)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Data storage tags (DSTs) record and store information about animals and their environment, and can provide important data relevant to fish culture, ecology and conservation. A DST has recently been developed that records heart rate (fH), electrocardiograms (ECGs), tri-axial acceleration and temperature. However, at the time of this study, no research using these tags had been performed on fish or determined the quality of the data collected. Thus, our research asked: do these DSTs provide reliable and meaningful data? To examine this question, Atlantic salmon (1.4 ± 0.7 kg) were implanted with DSTs, then swam at increasing speeds in a swim tunnel after 1 week of recovery. Further, in two separate experiments, salmon (2.4 ± 0.1 kg) were implanted with DSTs and held in a large tank with conspecifics for 1 week at 11 °C or 6 weeks at 8–12 °C. Results External acceleration (EA) and variation in EA (VAR) increased exponentially with swimming speed and tail beat frequency. The quality index (QI) assigned to ECG recordings (where QI0 means very good quality, and QI1, QI2 and QI3 are of reduced quality) did not change significantly with increasing swimming speed (QI0 ~ 60–80%). However, we found that the accuracy of the tag algorithm in estimating fH from ECGs was reduced when QI>0. Diurnal patterns of fH and EA were evident from the time the salmon were placed in the tank. Heart rate appeared to stabilize by ~ 4 days post-surgery in the first experiment, but extended holding showed that fH declined for 2–3 weeks. During extended holding, the tag had difficulty recording low fH values < 30 bpm, and for this reason, in addition to the fact that the algorithm can miscalculate fH, it is highly recommended that ECGs be saved when possible for quality control and so that fH values with QI>0 can be manually calculated. Conclusions With these DSTs, parameters of acceleration can be used to monitor the activity of free-swimming salmon. Further, changes in fH and heart rate variability (HRV) due to diurnal rhythms, and in response to temperature, activity and stressors, can be recorded.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».