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Enregistrement W3166005634 · doi:10.5194/egusphere-egu21-3587

The Last Interglacial in the Labrador Sea: a sedimentary ancient DNA investigation 

2021· article· en· W3166005634 sur OpenAlexaboutno aff
Danielle Grant, Kristine Steinsland, Sigrid Mugu, Katrine Sandnes Skaar, Umer Zeeshan Ijaz, Ulysses S. Ninneman, Jessica Louise Ray, Stijn De Schepper

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterglacialOceanographyGlacial periodPaleoceanographyClimate changeMarine isotope stagePaleontologyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Last Interglacial (LIG, ~128–116ka) was characterized by a warmer climate, increased sea level, and a reduced Greenland ice sheet compared to today. Climate projections suggest our future climate may resemble LIG conditions if anthropogenic climate change progresses unabated. Previous studies have identified key shifts in the Labrador Sea oceanography and climate before, during, and after the LIG, making this time interval an exciting target for exploring high-latitude marine ecological dynamics. In recent years, the application of sedimentary ancient DNA (sedaDNA) has provided new glimpses into past ocean and climate conditions. Here, we have explored sedaDNA alongside other, traditional, paleoceanography proxies, to better understand the changing Labrador Sea biome across climate transitions and in a globally warmer world. We have generated a sedaDNA record from a giant piston core at the Eirik Drift (Labrador Sea). Our sedaDNA record, dating back to ~135 ka, was sampled at 4 cm depth intervals and covers the glacial-interglacial transition, as well as the LIG. SedaDNA was purified using a commercial spin column kit and analysed using a metabarcoding approach targeting the V7 hypervariable region of the eukaryote small subunit RNA. Illumina MiSeq analysis of metabarcoding libraries revealed PCR-amplifiable eukaryotic DNA throughout the investigated downcore section. Shifts in relative taxon abundance and alpha- and beta-diversity metrics paralleled shifts in foraminifer isotope records (δ18Ο), palynological assemblages, and biomarkers suggesting that the molecular genetic signal preserved in downcore sediments shows promise for identifying ecological shifts across the LIG. We are currently investigating the potential utility of specific taxa identified in the sedaDNA record to act as indicators of the glacial-interglacial transition. This study strengthens the growing potential of marine sedaDNA as a supplemental proxy for climate reconstructions in the Late Quaternary.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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