Endosomal sorting of VAMP3 is regulated by Phosphatidylinositol 4‐kinase IIa
Notice bibliographique
Résumé
Membrane fusion along endocytic pathways is directly dependent on proper distribution of Soluble NSF‐attachment receptors (SNAREs). Although SNAREs are fairly promiscuous in vitro , significant specificity is achieved in vivo through spatial segregation and shielding of SNAREs prior to cognate Q‐SNARE binding. In particular, long R‐SNAREs are capable of autoinhibition, while short R‐SNAREs were shown to associate with phospholipids on vesicular membranes in vitro . However the exact regulation of this process and the potential lipid binding preference in vivo remains elusive. Here we have identified PtdIns4 P kinase PI4KIIa as a binding partner of VAMP3, a small recycling R‐SNARE. PI4KIIa depletion resulted in accumulation of VAMP3 on endosomal compartments, inhibited VAMP3 trafficking to perinuclear membranes and reduced the rate of VAMP3‐mediated transferrin recycling. Similarly, acute depletion of PtdIns4 P on endosomes significantly impaired VAMP3 sorting. In addition, VAMP3 association with its cognate Q‐SNARE Vti1a decreased upon PI4KIIa depletion. Taken together, these findings reveal a role for phospholipids in small R‐SNARE sorting, corroborating previous in vitro findings. Direct interaction with the lipid kinase PI4KIIa can, therefore, guarantee a localized supply of PtdIns4P to support the lipid requirement of endosomal SNARE function. Supported by the NICHD Intramural program
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».