High‐altitude Adaptation and Hypoxia Signaling in Deer Mice
Notice bibliographique
Résumé
The hypoxic and cold environment at high altitudes requires that endothermic animals sustain high rates of O 2 consumption for both locomotion and thermogenesis while facing a diminished O 2 supply. Recent evidence suggests that genes in the hypoxia inducible factor (HIF) pathway have been targeted by natural selection and have contributed to evolutionary adaptation to high altitudes in several species. Here, we examine the role of hypoxia signaling in high‐altitude adaptation in deer mice ( Peromyscus maniculatus ). Maximal O 2 consumption (VO 2 max) in hypoxia is augmented in high‐altitude populations, underpinned by increases in pulmonary O 2 extraction, arterial O 2 saturation, cardiac output, and tissue O 2 extraction compared to low‐altitude populations. Highlanders also maintain higher heart rates during deep hypoxia at rest. Associated with the population differences in physiology is extreme allele frequency variation in a non‐synonymous single nucleotide polymorphism in Epas1 , the gene encoding HIF‐2α. Transcriptome scans indicate that these differences in Epas1 allele frequency stem from a history of spatially varying selection between high and low altitudes. RNA‐Seq measurements of gene expression in the left ventricle show that transcriptomic variation in HIF target genes is correlated to VO 2 max. Furthermore, comparisons of the hypoxia response between mice with different Epas1 genotypes (captured from an admixed population on the summit Mount Evans CO) show that the high‐altitude Epas1 allele is associated with higher heart rates in deep hypoxia, but that it has no association with variation in breathing or blood haemoglobin content. Our results therefore suggest that changes in hypoxia signaling contribute to high‐altitude adaptation in deer mice. Support or Funding Information Supported by NSERC of Canada and the USA National Science Foundation
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».