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Enregistrement W3166403003 · doi:10.1002/mgg3.1726

Autosomal dominant variants in<i>FOXJ1</i>causing primary ciliary dyskinesia in two patients with obstructive hydrocephalus

2021· article· en· W3166403003 sur OpenAlexaff
Adam J. Shapiro, Kimberley Kaspy, Melissa Daniels, Jaclyn R. Stonebraker, Văn Hùng Nguyễn, Lyne Joyal, Michael R. Knowles, Maimoona A. Zariwala

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteRare Diseases Clinical Research Network
Mots-clésPrimary ciliary dyskinesiaHydrocephalusObstructive hydrocephalusMedicineDyskinesiaBioinformaticsPediatricsInternal medicineBiologySurgeryDiseaseParkinson's disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a mostly autosomal recessive, genetic disease of abnormal motile cilia function, resulting in bronchiectasis, infertility, organ laterality defects, and chronic otolaryngology disease. Though motile, ependymal cilia influencing cerebrospinal fluid flow in the central nervous system share many aspects of structure and function with motile cilia in the respiratory tract, hydrocephalus is rarely associated with PCD. Recently, pathogenic variants in FOXJ1 (Chr 17q25.1) were identified causing PCD associated with hydrocephalus, reduced respiratory cilia number, axonemal microtubule disorganization, and occurring in a de novo, autosomal dominant inheritance pattern. METHOD: Two patients with chronic oto-sino-pulmonary disease and hydrocephalus underwent candidate testing of FOXJ1. Coding region and splice junctions were sequenced and analyzed under the auspices of Genetic Disorders of Mucociliary Clearance Consortium. RESULTS: Upon sequencing of the entire coding region and splice-junctions, heterozygous, pathogenic variants in FOXJ1 were discovered in exon 3 of two patients: an 11-month-old female with situs inversus totalis (NM_001454.4: c.945delC (p.Phe315Leufs*18)) and a 51 year-old male, post-double lung transplantation (NM_001454.4: c.929_932delACTG (p.Asp310Glyfs*22)). FOXJ1 variants were not detected in the available parents and the siblings of these probands. CONCLUSION: FOXJ1 pathogenic variants cause PCD in a de novo, autosomal dominant inheritance pattern, and are associated with hydrocephalus. Physicians treating patients with hydrocephalus and chronic oto-sino-pulmonary disease should be aware of this PCD association and test for FOXJ1 variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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