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Enregistrement W3166410369 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.01542

A Direct CLIC5A/Ezrin Interaction Enables CLIC5A‐Dependent Rac1 Activation

2021· article· en· W3166410369 sur OpenAlexafffund
Md. Morshedur Rahman, Laiji Li, Barbara J. Ballermann

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEzrinCell biologyRadixinMoesinRAC1CytoskeletonActin cytoskeletonTransfectionChemistryBiologyBiochemistryCellSignal transductionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction The CLIC (Chloride Intracellular Channel) protein CLIC5A is a component of the ezrin/podocalyxin/actin complex in kidney podocytes, where it stabilizes actin‐based projections (foot processes). Similarly, in inner ear hair cells CLIC5A in the radixin complex stabilizes sensory stereocilia, also actin‐based projections. ERM ( e zrin, r adixin, m oesin) proteins help organize the cortical actin cytoskeleton, linking membrane‐spanning proteins to actin. We have reported that CLIC5A stimulates Rac1‐GTP‐dependent phosphatidylinositol‐4,5‐bisphosphate [PI(4,5)P2] generation, causing ezrin activation and phosphorylation, thus coupling podocalyxin, via ezrin, to the cytoskeleton ( J. Cell Sci. 127:5164, 2014 & Kidney Int. 89:833, 2016 ). Hypothesis Direct interaction(s) of CLIC5A with Rac1 and/or ezrin enable CLIC5A‐dependent Rac1 activation. Methods Rac1 activity was determined by Rac1‐GTP specific PAK‐PBD pull‐down from CLIC5A or vector transfected cells and by Rac1‐GTP G‐LISA ® (Cytoskeleton Inc). Association of CLIC5A with Rac1 was determined by GST‐CLIC5A pull‐down of exogenously expressed wild‐type GFP‐Rac1(WT), constitutively active GFP‐Rac1 (Q61L) and dominant negative GFP‐Rac1 (D17N) from COS7 cell lysates and by in vitro GST‐CLIC5A pull‐down of GTPγS‐ or GDP‐loaded recombinant His‐Rac1. Direct protein‐protein interactions were evaluated by Yeast two‐Hybrid (Y2H) screening of a mouse kidney protein domain library, and Y2H mapping of interacting domains in the related ERM protein ezrin, using CLIC5A as the bait (Fig 1A). The CLIC5A/ezrin association was studied by co‐immunoprecipitation and GST‐CLIC5A pull‐down. Results Exogenous CLIC5A expression activated Rac1 and CLIC5A was co‐precipitated with Rac1‐GTP and ezrin by PAK‐PBD affinity beads. GST‐CLIC5A pulled GFP‐Rac1 WT, ‐Q61L, and ‐D17N equally from cell lysates, but recombinant GTPγS‐ or GDP‐loaded His‐Rac1 did not directly bind GST‐CLIC5A, suggesting that the CLIC5A/Rac1 interaction is indirect. The Y2H screen revealed that CLIC5A interacts directly with the C‐terminal domain of radixin, and Y2H mapping (Fig. 1A) showed that CLIC5A similarly interacts directly with the ezrin C‐terminal domain (432‐586). Direct interactions with full‐length ezrin (1‐586) and the C‐terminally deleted ezrin (432‐570) domain were not detected. Furthermore, ezrin (432‐586), but not full‐length ezrin (1‐586) or ezrin (432‐570) was pulled down by GST‐CLIC5A and co‐immunoprecipitated with CLIC5A. Finally, siRNA silencing of endogenous ezrin significantly reduced CLIC5A‐stimulated Rac1 activation (Fig. 1B). Conclusion Although CLIC5A activates Rac1 and is part of the Rac1‐GTP complex, the CLIC5A/Rac1 interaction appears to be indirect. CLIC5A interacts directly with ezrin (and radixin), and Rac1 activation by CLIC5A is ezrin‐dependent. The finding that a direct interaction of CLIC5A with full‐length ezrin was not detected suggests that only the active, open ezrin conformation, freeing the C‐terminus, has a high affinity for CLIC5A. The data suggest that the direct CLIC5A/ezrin interaction may enhance localized Rac1 activation and thus Rac1‐GTP‐dependent PI(4,5)P2 generation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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