Muscular Coloration Diversity and Microsatellite Genetic Differentiation for the Clam <i>Paphia amabilis</i> (Philippi, 1847)
Notice bibliographique
Résumé
Paphia amabilis is an important fishery shellfish widely distributing along Southeast Asia coast. The muscles of its foot and siphons are commonly colored bright red-orange due to the presence of C37 skeletal carotenoids. However, 10.5%-18.6% of yellow-muscled individuals (YMs) were found among the four P . amabilis wild samples from Vietnam (Co To island, CT) and China (Beihai, BH/BHA, Guangxi Province; and Zhanjiang, ZJ, Guangdong Province), the north of Beibu Gulf, South China Sea. Twenty genomic microsatellite markers were developed and 12 were employed to analyze the population genetic differentiation of three geographical populations (CT, BH, and ZJ, n=32/population), as well as YM and RM (red-muscled) subpopulations. Medium levels of genetic diversity were detected in all three populations with the number of alleles ranging from 4-21 (8.4±4.5) for CT, 4-16 (7.6±3.3) for BH and 4-18 (7.5±3.7) for ZJ. The average observed/expected heterozygosities were 0.66/0.66 for CT, 0.62/0.63 for BH, and 0.55/0.62 for ZJ, respectively. Total 4 out of 36 tests of microsatellites deviated from Hardy–Weinberg equilibrium (HWE, P <0.05 after Bonferroni correction), all in ZJ population due to the presence of null alleles suggested by MICRO-CHECK. Exact test indicated highly significant differentiations ( F ST ) between Vietnamese and two Chinese populations (0.099/0.123 between CT and BH/ZJ). No allele of any microsatellite marker was found significantly associated with muscularcoloration of P. amabilis , consequently no convergent microsatellite genetic differentiation presents between YM and RM subpopulations, supporting that epigenetic factor might play an important role in carotenoids accumulation of P. amabilis .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».