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Enregistrement W3166731046 · doi:10.1101/2021.06.10.21258677

A convolutional-recurrent neural network approach to resting-state EEG classification in Parkinson’s disease

2021· preprint· en· W3166731046 sur OpenAlexafffund
Soojin Lee, Ramy Hussein, Rabab Ward, Z. Jane Wang, Martin J. McKeown

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésConvolutional neural networkElectroencephalographyComputer scienceRecurrent neural networkArtificial intelligenceDeep learningMachine learningRecallPopulationParkinson's diseaseDiseasePattern recognition (psychology)Artificial neural networkNeuroscienceMedicinePsychologyPathologyCognitive psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Parkinson’s disease (PD) is expected to become more common, particularly with an aging population. Diagnosis and monitoring of the disease typically rely on the laborious examination of physical symptoms by medical experts, which is necessarily limited and may not detect the prodromal stages of the disease. New Method We propose a lightweight (∼20K parameters) deep learning model, to discriminate between resting-state EEG recorded from people with PD and healthy controls. The proposed CRNN model consists of convolutional neural networks (CNN) and a recurrent neural network (RNN) with gated recurrent units (GRUs). The 1D CNN layers are designed to extract spatiotemporal features across EEG channels, which are subsequently supplied to the GRUs to discover temporal features pertinent to the classification. Results The CRNN model achieved 99.2% accuracy, 98.9% precision, and 99.4% recall in classifying PD from healthy controls (HC). Interrogating the model, we further demonstrate that the model is sensitive to dopaminergic medication effects and predominantly uses phase information of the EEG signals. Comparison with Existing Methods The CRNN model achieves superior performance compared to baseline machine learning methods and other recently proposed deep learning models. Conclusion The approach proposed in this study adequately extracts the spatial and temporal features in multi-channel EEG signals that enable the accurate differentiation between PD and HC. It has excellent potential for use as an oscillatory biomarker for assisting in the diagnosis and monitoring of people with PD. Future studies to further improve and validate the model’s performance in clinical practice are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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