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Enregistrement W3166971861 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.628.2

Maternal Genetic Risk Factors for Infant Zinc Deficiency

2013· article· en· W3166971861 sur OpenAlexafffund
James K. Friel, Sandra Castilo San Juan, Wafaa Qasem, Alejandra Serrano León, Natasha Yurkova, Peter Eck

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChesapeake Research Consortium
Mots-clésSecretionBiologyPlasmidSingle-nucleotide polymorphismZinc deficiency (plant disorder)ZincGenotypeGeneticsGeneBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zinc is an essential constituent of catalytic sites of multiple enzymes. Since all of these enzymes are involved in cellular functions, zinc deficiency will have adverse effects on reproduction, normal growth and development. Zinc deficiency was reported in healthy term infants and attributed to a decrease in zinc secretion in maternal breast milk (BM). Two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the membrane transporter SLC30A2 (ZnT2) cause decreased zinc secretion into BM. Through bioinformatics analysis we identified 14 additional SNPs causing amino acid changes. We aim to identify the functional changes caused by these 14 SNPs, with the initial objective to identify possible cellular mislocalization. We subcloned the SLC30A2 open reading frames into the Gateway entry plasmid pDONR221 and introduced the 14 SNPs using site directed mutagenesis. During transfer into expression plasmid we tagged SLC30A2 with red and green fluorescent proteins (mCherry, tGFP). We transfected individual plasmids into mammary epithelial cells and observed cellular targeting using epifluorescent imaging. The most common variants locate to secreting endosomes in mammary epithelial cells. Incorrect targeting of SLC30A2 eliminates its role in zinc secretion, resulting in zinc depleted BM. Mothers carrying risk genotypes for infant zinc deficiency can be identified. Funded by CRC and CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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