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Enregistrement W3167032940 · doi:10.5376/mpb.2021.12.0017

Development of SSR Markers Associated with Polima CMS Fertility Restorer in <i>Brassica napus</i> L. and Its Application

2021· article· en· W3167032940 sur OpenAlexvenueno aff
Bao Li, Yiming Guo, Yaoting Zhang, Xinhong Liu, Lianyi Fan, Liang Qu, Lichao Deng, Mei Li

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNitrogen and Sulfur Effects on Brassica
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHunan Academy of Agricultural Sciences
Mots-clésCytoplasmic male sterilityBiologyHybridPopulationGeneticsGenetic markerRapeseedHybrid seedDoubled haploidySterilityGeneBotanyQuantitative trait locus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Polima system of cytoplasmic male sterility (Pol CMS) was widely used for hybrid seed production, but with high probability of occurrence of maternal false hybrid due to the fertility of Polima CMS (Pol CMS) line greatly affected by the ambient temperature, therefore, the detection of maternal false hybrids is the key to purity identification. In present study, the SSR markers were designed based on the flanking sequences of Pol CMS restorer gene  Rfp , and application of SSR markers in hybrid seed purity test of rapeseed. The main results were as follows: the sequences of  Rfp  were subjected to basic local alignment search tool queries against the  Brassica rapa  genome to determine chromosome positions, and 32 SSR markers were developed based on the upstream and downstream sequences of  Rfp . Among the 32 SSR markers, one codominant marker was polymorphic between Pol CMS sterile and restorer line, the PCR product length was 162 bp in Pol CMS sterile lines, and 184 bp in restorer lines. Based on the PCR sequence, two insert fragments (15 bp and 7 bp) were identified in Pol CMS restorer lines. The SSR marker co-segregated with plant fertility of individuals in the “fengyou737” F 2  population. The purity of “fengyou737”, “fengyou320” and “fengyou958” were identified by means of PCR-SSR markers and field-planting, and the results of two ways were highly consistent, indicated that the codominant SSR marker tightly linked to  Rfp , and the marker can detect paternal and maternal false hybrids. The present findings will provide technical assistance for hybrid seed purity test and genetic diversity analysis in rapeseed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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