MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3167326398 · doi:10.1038/s41419-021-03871-w

The RNA-binding protein HuR is a novel target of Pirh2 E3 ubiquitin ligase

2021· article· en· W3167326398 sur OpenAlexfundno aff
Alexandra Daks, Alexey Petukhov, Olga Fedorova, Oleg Shuvalov, Alena Kizenko, Elizaveta Tananykina, Elena Vasileva, Oleg Semenov, Andrew R. Bottrill, Nickolai A. Barlev

Notice bibliographique

RevueCell Death and Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRussian Science FoundationNational Institutes of HealthRussian Foundation for Basic ResearchYork University
Mots-clésUbiquitin ligaseRNA-binding proteinRNA splicingSmall interfering RNAUbiquitinProtein degradationRNABiologyCell biologyChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The RING-finger protein Pirh2 is a p53 family-specific E3 ubiquitin ligase. Pirh2 also ubiquitinates several other important cellular factors and is involved in carcinogenesis. However, its functional role in other cellular processes is poorly understood. To address this question, we performed a proteomic search for novel interacting partners of Pirh2. Using the GST-pulldown approach combined with LC-MS/MS, we revealed 225 proteins that interacted with Pirh2. We found that, according to the GO description, a large group of Pirh2-associated proteins belonged to the RNA metabolism group. Importantly, one of the identified proteins from that group was an RNA-binding protein ELAVL1 (HuR), which is involved in the regulation of splicing and protein stability of several oncogenic proteins. We demonstrated that Pirh2 ubiquitinated the HuR protein facilitating its proteasome-mediated degradation in cells. Importantly, the Pirh2-mediated degradation of HuR occurred in response to heat shock, thereby affecting the survival rate of HeLa cells under elevated temperature. Functionally, Pirh2-mediated degradation of HuR augmented the level of c-Myc expression, whose RNA level is otherwise attenuated by HuR. Taken together, our data indicate that HuR is a new target of Pirh2 and this functional interaction contributes to the heat-shock response of cancer cells affecting their survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell Death and DiseaseMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207