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Enregistrement W3167328025 · doi:10.1101/2021.06.01.446620

Simulating brain signals with predefined mutual correlations – a technical note

2021· preprint· en· W3167328025 sur OpenAlexaff
Alexander A. Moiseev

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceSet (abstract data type)SIGNAL (programming language)WaveformTask (project management)Noise (video)Expression (computer science)Function (biology)Envelope (radar)AlgorithmMixing (physics)Contrast (vision)Mutual informationArtificial intelligencePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective When modeling task-related human brain activity it is often necessary to simulate brain signals with specific mutual correlations between them. The signals should resemble those observed in practice, and consist of an “evoked” (“phase-locked”) component and a random oscillatory part. To be neurophysiologically plausible their waveforms must be shaped in a certain way or exhibit specific global features; in technical terms - they should be modulated by a certain envelope function. The goal of this technical note is to describe a simple way of how such signal sets can be obtained. Methods We derive a procedure which allows generating multi-epoch signals with the above properties. This is done by mixing a “seed” set of waveforms typically reflecting particular qualities of the target brain activity. As an example, the seed set can consist of realizations of colored noise with desired power spectrum, or can be obtained from real brain measurements. Results The algorithm yields a set of n multi-epoch signals with specified mutual correlations. Evoked parts, oscillatory parts and global envelopes of the signals can be controlled independently in order to obtain desired properties of the generated time courses. Conclusion The procedure provides versatile sets of mutually correlated signals suitable for modeling task-related brain activity. Significance In contrast to other methods often relying on complicated computations, the suggested approach is straightforward and easy to apply in everyday practical work, yet yielding realistic “functionally connected” simulated brain signals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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