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Enregistrement W3167505290 · doi:10.1093/neuonc/noab090.176

RARE-15. THE MOLECULAR PROFILE OF SECONDARY MENINGIOMAS IN SURVIVORS OF CHILDHOOD NON-CENTRAL NERVOUS SYSTEM CANCERS

2021· article· en· W3167505290 sur OpenAlexaff
Catherine Corriveau‐Bourque, Derek Wong, Frank K.H. van Landeghem, Matija Snuderl, Maria Spavor, Stephen Yip, David D. Eisenstat

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCohortMeningiomaRadiation therapyExome sequencingOncologyCancerInternal medicineSurgeryBiologyMutationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Cranial irradiation remains part of childhood cancer therapy and secondary meningiomas are a late effect. Secondary meningiomas are reported in patients who received low and high dose cranial irradiation and arise ~ 20 years post exposure. The molecular and genetic profile of primary meningiomas has been well studied; however, only a few studies describe these in radiation-induced meningiomas (RIM). Methods We identified patients followed at the Childhood Cancer Survivor Clinic, Stollery Children’s Hospital who had a history of non-central nervous system malignancies and received cranial irradiation who developed meningiomas between clinic inception in 1971 and June 2013. Whole exome sequencing (WES) as well as DNA methylation profiling were performed for patients where tumor and germline DNA were available. Results Of 96 patients who received cranial irradiation, 16 (16.7%) developed symptomatic meningiomas. This patient cohort is unique; all 16 patients received 2000–2400 cGy, suggesting a threshold dose. 9/16 (56%) had WHO Grade 2 meningiomas or greater and 7/16 (44%) were infiltrative. Post-surgical recurrences occurred in 43%. Patients experienced considerable morbidities directly attributable to the meningiomas or their treatment. 14 patients had samples suitable for further analysis. Preliminary results revealed that NF2 mutations were the most common (5). Other meningioma related genes with mutations identified in our patient cohort include TRAF7, AKT3, MSH4 (2), KMT2C (2), TET1 (2), KDM6A, and MLH3. Copy number alternations were noted with increased frequency on chromosomes 1p, 22q, 19q. 850k methylation analysis did not conclusively show any clustering. Ongoing studies include assessment of tumor mutation burden, RNAseq, and the mutational profile. Conclusions This study examined RIM in patients who received similar doses of radiation for their childhood cancer. To date, our findings are consistent with previously described primary and RIM mutations. Enhanced knowledge in secondary meningiomas is crucial for accurate patient counseling, prognostication, and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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