Salmonella enterica serovars associated with bacteremia in Canada, 2006–2019
Notice bibliographique
Résumé
Background: Members of the bacterial genus Salmonella cause salmonellosis, a disease with a spectrum of clinical presentations from a self-limiting gastroenteritis to more severe bacteremia, organ failure and sepsis. The genus consists of over 2,600 serological variants (serovars). Important differences in the pathogenesis of Salmonella serovars have been noted. Objective: The purpose of this study was to determine which Salmonella serovars were more likely to be associated with bacteremia in Canada. Methods: Information on the total number of Salmonella infections and blood isolations reported to the National Enteric Surveillance Program (NESP) from 2006 to 2019 was extracted for each serovar. The risk (proportion) and likelihood (odds) of bacteremia were calculated for all serovars. Results: Of the 96,082 Salmonella cases reported to the NESP during the 14-year study period, 4.4% (95% CI: 4.3%–4.6%) were bacteremic. Twenty nontyphoidal Salmonella (NTS) serovars were associated with lower rates of bacteremia compared to all NTS serovars, and 19 NTS serovars were identified as having higher rates. Heidelberg, Oranienburg, Schwarzengrund, Virchow, Panama and Poona among the top 25 most commonly reported serovars in Canada during the study period. Conclusion: The identification of serovars associated with Salmonella bacteremia in Canada is a first step towards understanding differences in pathogenesis and disease presentation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».