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Enregistrement W3167808045 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.995.4

Nuclear MMP‐2: presence and activity in cardiac myocytes

2013· article· en· W3167808045 sur OpenAlexaffabout
Márcia Y. Kondo, Michele M. Castro, Frank Fan, Richard Schulz

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytoplasmCytosolNuclear matrixNucleusWestern blotBlotLaminGlyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenaseMatrix metalloproteinaseInner membraneChemistryCell biologyPhosphorylationSubcellular localizationCell nucleusMolecular biologyMitochondrionBiochemistryBiologyGene expressionEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MMP‐2 is expressed in almost all heart cells and is found in subcellular compartments including the nucleus. MMP‐2 can be directly activated by oxidative stress (as peroxynitrite). Its activity is further regulated by its phosphorylation. To better study nuclear MMP‐2 in the heart, we extracted the nuclear, cytosolic and membrane fractions from isolated rat hearts (briefly perfused to clear them of blood). Western Blots for lamin A/C (nucleus), GAPDH (cytosol) and VDAC/Porin (membrane) were used as specific markers to confirm fraction purity. Gelatin zymography of these fractions revealed MMP‐2 but not MMP‐9 activities and MMP‐2 activity was about 15 times higher in the cytoplasm than in the nucleus. Interestingly, Western blot analysis showed that MMP‐2 is present in similar amounts both in the nucleus and in the cytoplasm. In order to characterize possible regulators of MMP‐2 activity, we analyzed for the presence of tissue inhibitors of metalloproteases (TIMPs). Western blots revealed that all forms of TIMPs (1–4) are found in the cytoplasm, TIMP‐4 is also present in the membrane fraction, and no TIMP was detected in the nucleus. Our data suggest that myocardial MMP‐2 activity in the nucleus is regulated by a mechanism different from inhibition by TIMPs, possibly by its phosphorylation. Funding: Canadian Institutes of Health Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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