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Enregistrement W3168094137 · doi:10.1139/cjps-2020-0118

Transcriptomic analysis reveals anthocyanin biosynthesis regulation in blueberry (<i>Vaccinium ashei</i>) fruit

2021· article· en· W3168094137 sur OpenAlexvenueno aff
Xuan Gao, Qiang Chen, Yan Yang, Bo Zhu, Jiaxin Xiao

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRipeningVacciniumAnthocyaninTranscriptomeBiologyBerryBotanyEricaceaeBiosynthesisAbscisic acidMADS-boxPigmentGeneHorticultureGene expressionBiochemistryArabidopsisChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blueberry (Vaccinium ashei) is a popular fruit due to its high anthocyanin content. This study aimed to analyze the transcriptome profile of V. ashei cv. ‘Brightwell’ fruits at different stages of development. A total of 314.26 GB of clean data were obtained and de novo assembled into 254 196 unigenes. In comparisons between the early and late stages of fruit ripening, 27 genes (including PAL, CHS, F3H, F3′H, F3′5′H, LDOX, etc.) were found to cover the main steps in the anthocyanin biosynthesis pathway. Most of these genes were highly expressed in the late stage of fruit development, suggesting that anthocyanins mainly accumulate in the late stage. During the late stage of fruit development, most structural and regulatory genes such as F3′5′H and F3′H, which are involved in the anthocyanin biosynthetic pathway, were upregulated, causing the fruit to turn blue. Decreased expression of a large number of chloroplast-related genes during the fruit ripening period could explain why the green fruit color fades over time. Additionally, abscisic acid and ethylene may play positive roles in promoting fruit ripening and anthocyanin accumulation. This research reveals the transcriptomic characteristics of immature and mature fruits and enhances our understanding of the molecular mechanisms of anthocyanin biosynthesis and accumulation in blueberry fruit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil0,944

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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