Transcriptomic analysis reveals anthocyanin biosynthesis regulation in blueberry (<i>Vaccinium ashei</i>) fruit
Notice bibliographique
Résumé
Blueberry (Vaccinium ashei) is a popular fruit due to its high anthocyanin content. This study aimed to analyze the transcriptome profile of V. ashei cv. ‘Brightwell’ fruits at different stages of development. A total of 314.26 GB of clean data were obtained and de novo assembled into 254 196 unigenes. In comparisons between the early and late stages of fruit ripening, 27 genes (including PAL, CHS, F3H, F3′H, F3′5′H, LDOX, etc.) were found to cover the main steps in the anthocyanin biosynthesis pathway. Most of these genes were highly expressed in the late stage of fruit development, suggesting that anthocyanins mainly accumulate in the late stage. During the late stage of fruit development, most structural and regulatory genes such as F3′5′H and F3′H, which are involved in the anthocyanin biosynthetic pathway, were upregulated, causing the fruit to turn blue. Decreased expression of a large number of chloroplast-related genes during the fruit ripening period could explain why the green fruit color fades over time. Additionally, abscisic acid and ethylene may play positive roles in promoting fruit ripening and anthocyanin accumulation. This research reveals the transcriptomic characteristics of immature and mature fruits and enhances our understanding of the molecular mechanisms of anthocyanin biosynthesis and accumulation in blueberry fruit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».