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Enregistrement W3168115304 · doi:10.1158/0008-5472.can-21-0950

NCI Imaging Data Commons

2021· article· en· W3168115304 sur OpenAlexaff
Andriy Fedorov, William J.R. Longabaugh, David Pot, David Clunie, Steve Pieper, Hugo J.W.L. Aerts, André Homeyer, Rob Lewis, Afshin Akbarzadeh, Dennis Bontempi, William Kingdon Clifford, Markus D. Herrmann, Henning Höfener, Igor Octaviano, Chad Osborne, Suzanne Paquette, James Petts, Davide Punzo, Madelyn Reyes, Daniela P. Schacherer, Tian Mi, G. Edward White, Erik Ziegler, Ilya Shmulevich, Todd Pihl, Ulrike Wagner, Keyvan Farahani, Ron Kikinis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Cancer Institute
Mots-clésDocumentationCloud computingData scienceCommonsComputer scienceCyberinfrastructurePolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The National Cancer Institute (NCI) Cancer Research Data Commons (CRDC) aims to establish a national cloud-based data science infrastructure. Imaging Data Commons (IDC) is a new component of CRDC supported by the Cancer Moonshot. The goal of IDC is to enable a broad spectrum of cancer researchers, with and without imaging expertise, to easily access and explore the value of deidentified imaging data and to support integrated analyses with nonimaging data. We achieve this goal by colocating versatile imaging collections with cloud-based computing resources and data exploration, visualization, and analysis tools. The IDC pilot was released in October 2020 and is being continuously populated with radiology and histopathology collections. IDC provides access to curated imaging collections, accompanied by documentation, a user forum, and a growing number of analysis use cases that aim to demonstrate the value of a data commons framework applied to cancer imaging research. SIGNIFICANCE: This study introduces NCI Imaging Data Commons, a new repository of the NCI Cancer Research Data Commons, which will support cancer imaging research on the cloud.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,076
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,991
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,076
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0120,017
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0100,009
Science ouverte0,0090,016
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0750,045

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,161
Tête enseignante GPT0,509
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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