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Enregistrement W3168252000 · doi:10.1200/jco.2021.39.15_suppl.e12590

H&E-like histology of unstained fresh and formalin fixed breast tissue with Photo Acoustic Remote Sensing (PARS) microscopy.

2021· article· en· W3168252000 sur OpenAlexaff
John R. Mackey, Benjamin R. Ecclestone, Deepak Dinakaran, Gilbert Bigras, Parsin Haji Reza

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPathologyH&E stainHistologyMedicineStainingMicroscopyFrozen section procedureBreast cancerCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e12590 Background: Approximately 30% of breast cancer patients undergoing breast-conserving surgery (BCS) require re-excision(s) to obtain clear margins, causing delays in adjuvant treatment, poor aesthetic results, and increased infection rates, costs, and patient anxiety. Frozen section pathology assessment (FSA) reduces re-excision rates from 27% to 6%, but FSA extends operative times and has a false negative rate of 17%. Photo-Acoustic Remote Sensing (PARS) is a new laser-based light microscope that permits non-contact cellular resolution imaging of unstained tissues. Methods: We used an ultraviolet reflection-mode PARS microscope to study i) formalin-fixed, paraffin embedded (FFPE) breast tissue blocks, ii) unstained thin sections of FFPE invasive ductal carcinoma and ductal carcinoma in situ, iii) formalin fixed bulk surgical specimens of benign and malignant human breast tissue, and iv) benign and malignant fresh rodent mammary tissue without fixation, processing, or staining. Fresh tissues were imaged after a range of warm ischemic times and across a range of cold ischemic times in neutral phosphate buffered saline at 4°C. For each condition, an ultraviolet laser was used to excite DNA and other cellular components in these samples, and signals were captured using a continuous-wave detection laser. The PARS signal was false-colored to closely replicate traditional hematoxylin and eosin staining. Results: In all fixed tissues, PARS virtual histology images were of diagnostic quality, permitted margin assessment, and analogous to transmission light microscopy of standard hematoxylin and eosin-stained FFPE slides, achieved without tissue sectioning or tissue staining. Furthermore, PARS microscopy also provided cellular level virtual histology images in fresh breast tissue with warm and cold ischemic times ranging from twenty minutes to two hours; these images have no available clinical comparators as non-contact cellular level imaging of unprocessed fresh tissue has not previously been reported. In aggregate, we demonstrate the feasibility of PARS to provide diagnostic and margin assessment images across a range of tissues including formalin fixed and freshly resected, unstained, unprocessed breast tissue. Conclusions: PARS is a new microscope technology addressing the practical needs of intraoperative margin assessment during BCS: i) no requirement for tissue staining, ii) rapid acquisition of hematoxylin and eosin-like images without the requirement for tissue freezing, embedding, or sectioning, iii) diagnostic quality cellular resolution, and iv) assessment of resected bulk tissue margins. In principle, this technology may also permit label-free non-contact intraoperative margin assessment of the surgical cavity. These data support the clinical development and evaluation of PARS microscopic intraoperative assessment of BCS margins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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