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Enregistrement W3168262637 · doi:10.1101/2021.03.25.21253623

Early onset leprosy reveals a joint effect of <i>LRRK2</i> and <i>NOD2</i> variants

2021· preprint· en· W3168262637 sur OpenAlexafffund
Monica Dallmann-Sauer, Yong Zhong Xu, Ana Lúcia França da Costa, Shao Tao, Wilian Correa-Macedo, Jérémy Manry, Laurent Abel, Alexandre Alcaïs, Aurélie Cobat, Vinicius M. Fava, Christian Probst, Marcelo Távora Mira, Erwin Schurr

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLeprosy Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHealth Resources and Services AdministrationUniversidade Federal do PiauíAgence Nationale de la RechercheMcGill University Health CentrePontificia Universidade Católica do ParanáMcGill University
Mots-clésLRRK2NOD2BiologyMutationMutantPhenotypeGeneWild typeGeneticsCancer researchImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Leprosy, caused by Mycobacterium leprae , has a long incubation period and cases with age-of-onset &lt;5 years are rare. Here, we studied a three-generational multiplex leprosy family which included monozygotic twins age &lt;24 months suffering from paucibacillary leprosy. Whole genome sequencing identified a homozygous double mutation in the LRRK2 gene (N551K, R1398H) and a heterozygous mutation in NOD2 (R702W) as candidate variants underlying the early onset phenotype in the twins. The same amino acid substitutions had previously been identified as shared risk-modulating factors for Crohn’s disease and Parkinson’s disease. To evaluate the functional impact of the LRRK2 mutations, we employed genome editing in RAW264.7 cells. Cells expressing the LRRK2 variants displayed reduced respiratory burst and apoptosis following mycobacterial challenge. Moreover, the BCG-induced respiratory burst was significantly lower in LRRK2 wild-type-expressing cells transfected with NOD2 R702W compared with NOD2 wild-type constructs. Employing co-immunoprecipitation, we showed that LRRK2 and NOD2 wild-type proteins interact in RAW cells. This interaction was independent of the LRRK2 variants but strongly reduced for NOD2 R702W. However, N-glycolyl MDP-triggered RIP2 phosphorylation and NF-kB activation were additively reduced by both LRRK2 and NOD2 mutations. Finally, we observed a joint effect of LRRK2 and NOD2 variants on cytokine/chemokine secretion with the most significant reduction of secretion observed for the mutant genotypes carried by the twins. These data demonstrated the pleiotropic effects of LRRK2 and NOD2 in response to mycobacterial infection consistent with a role of the identified mutations in the development of early onset leprosy. One Sentence Summary Variants of NOD2 and LRRK2 shared between early onset leprosy, Parkinson’s and Crohn’s disease jointly impact the anti-mycobacterial host response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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