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Enregistrement W3168389144 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjab073.094

DOP55 Histopathological features at diagnosis to predict long-term disease course of Crohn’s Disease

2021· article· en· W3168389144 sur OpenAlexaboutno aff
Ashkan Rezazadeh Ardabili, Danny Goudkade, D Wintjens, Mariëlle Romberg‐Camps, Björn Winkens, Marieke Pierik, Heike I. Grabsch, Daisy Jonkers

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDiseaseReceiver operating characteristicLogistic regressionInternal medicineCrohn's disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Crohn’s disease (CD) is characterized by a heterogeneous disease course and treatment response. There is a clinical need to identify CD patients at diagnosis who are at risk for developing a severe disease course. Patient stratification using state-of-the-art clinical, serological or genetic markers does not predict disease course sufficiently to facilitate clinical decision making. The current study aimed to investigate the additive predictive value of histopathological features at diagnosis to discriminate between patients with a long-term mild and severe disease course. Methods Diagnostic biopsies from treatment-naïve CD patients with mild or severe disease courses in the first 10 years after diagnosis (i.e. based on the number of quarterly flares) were reviewed by two senior gastrointestinal pathologists after developing a standardized form comprising 15 histopathological features related to acute and chronic inflammation. Multivariable logistic regression models were built to identify predictive features and compute receiver operating characteristics (ROC) curves. Model 1 included clinically relevant baseline characteristics (Montreal classification, smoking status and gender). Next, histopathological were added by applying two different model-building strategies (forward selection and purposeful selection algorithm)(Model 2). Prediction models were internally validated using bootstrapping to obtain optimism-corrected performance estimates. Results In total, 817 biopsies from 137 CD patients (64 mild disease course, 73 severe disease course) were included. Based on clinical baseline characteristics alone, disease course could only be moderately predicted (Model 1 Area under ROC (AUROC): 0.738 (optimism 0.018), 95%CI 0.65–0.83, sensitivity 83.6%, specificity 53.1%). When adding histopathological features, in colonic, but not ileal, biopsies a combination of (1) basal plasmacytosis, (2) severe lymphocyte and plasma cell infiltration in the lamina propria, (3) Paneth cell metaplasia and (4) absence of ulcers were identified and resulted in significantly better prediction of a severe disease course (Model 2 AUROC: 0.883 (optimism 0.033), 95%CI 0.82–0.94, sensitivity 80.4%, specificity 84.2%, model 2 vs. model 1 AUROC p = 0.001)[Figure 1]. Conclusion In this first study investigating the additive predictive value of multiple histopathological features in biopsies at CD diagnosis, we found that certain features of chronic inflammation in colonic biopsies contributed to prediction of a severe disease course, thereby presenting a novel approach to improve stratification and facilitate clinical decision making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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