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Enregistrement W3168462495 · doi:10.3389/fvets.2021.665805

Revisiting Ophidiomycosis (Snake Fungal Disease) After a Decade of Targeted Research

2021· article· en· W3168462495 sur OpenAlexafffundabout
Christina M. Davy, Leonard Shirose, Doug Campbell, Rachel M. Dillon, Christina McKenzie, Nicole M. Nemeth, Tony Braithwaite, Hugh Y. Cai, Tarra Degazio, Tammy Dobbie, Sean E. Egan, Heather Fotherby, Jacqueline D. Litzgus, Pilar Manorome, Steve Marks, James E. Paterson, Lynne Sigler, Ðurđa Slavić, Emily Slavik, John Urquhart, Claire M. Jardine

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAmphibian and Reptile Biology
Établissements canadiensUniversity of AlbertaLaurentian UniversityCanadian Science Centre for Human and Animal HealthUniversity of GuelphCanadian Wildlife FederationTrent UniversityMinistry of Natural Resources and Forestry
Organismes subventionnairesCanadian Wildlife Health CooperativeGovernment of OntarioOntario Ministry of Natural Resources and Forestry
Mots-clésIncidence (geometry)CaptivityPopulationZoologyBiologyDiseaseConfoundingNearctic ecozoneMedicinePathologyTaxonomy (biology)Environmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Emerging infectious diseases (EIDs) are typically characterized by novelty (recent detection) and by increasing incidence, distribution, and/or pathogenicity. Ophidiomycosis, also called snake fungal disease, is caused by the fungus Ophidiomyces ophidiicola (formerly “ ophiodiicola” ). Ophidiomycosis has been characterized as an EID and as a potential threat to populations of Nearctic snakes, sparking over a decade of targeted research. However, the severity of this threat is unclear. We reviewed the available literature to quantify incidence and effects of ophidiomycosis in Nearctic snakes, and to evaluate whether the evidence supports the ongoing characterization of ophidiomycosis as an EID. Data from Canada remain scarce, so we supplemented the literature review with surveys for O. ophidiicola in the Canadian Great Lakes region. Peer-reviewed reports of clinical signs consistent with ophidiomycosis in free-ranging, Nearctic snakes date back to at least 1998, and retrospective molecular testing of samples extend the earliest confirmed record to 1986. Diagnostic criteria varied among publications ( n = 33), confounding quantitative comparisons. Ophidiomycosis was diagnosed or suspected in 36/121 captive snakes and was fatal in over half of cases (66.7%). This result may implicate captivity-related stress as a risk factor for mortality from ophidiomycosis, but could also reflect reporting bias (i.e., infections are more likely to be detected in captive snakes, and severe cases are more likely to be reported). In contrast, ophidiomycosis was diagnosed or suspected in 441/2,384 free-ranging snakes, with mortality observed in 43 (9.8 %). Ophidiomycosis was only speculatively linked to population declines, and we found no evidence that the prevalence of the pathogen or disease increased over the past decade of targeted research. Supplemental surveys and molecular (qPCR) testing in Ontario, Canada detected O. ophidiicola on 76 of 657 free-ranging snakes sampled across ~136,000 km 2 . The pathogen was detected at most sites despite limited and haphazard sampling. No large-scale mortality was observed. Current evidence supports previous suggestions that the pathogen is a widespread, previously unrecognized endemic, rather than a novel pathogen. Ophidiomycosis may not pose an imminent threat to Nearctic snakes, but further research should investigate potential sublethal effects of ophidiomycosis such as altered reproductive success that could impact population growth, and explore whether shifting environmental conditions may alter host susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,227
Score d'incertitude au seuil0,846

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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