DNA-barcode and endophallus morphology delimit congruent species in a systematic revision of the oxyporine rove beetles of Russia (Coleoptera: Staphylinidae: Oxyporinae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rigorous species delimitation is a challenge in biology and systematics in particular. In insects, male genitalia traditionally, and the barcoding region of the CO1 gene recently, are the main markers to identify species, even though a standalone use of CO1 for that is often criticized. In our systematic revision of the mycophagous and in other ways peculiar oxyporine rove beetles of Russia, the legacy alpha-taxonomy could not be improved by traditional investigation of genitalia as they are unusually character-poor in this group. Using phylogenetic inference and ancestral state reconstruction, we demonstrate that CO1 and endophallus are useful markers for species delimitation in Oxyporus. We also show that many morphological traits previously used for species delimitation in Oxyporus are in fact highly variable and thus inconsistent. We hypothesize that in Oxyporus diversification of the endophallic structures is driven by intense intra- and inter-species interactions of multiple individuals co-occurring in narrow spaces inside fungal bodies during mating. Our results encourage broader use of both markers, especially easy-to-generate dna barcodes, for the desired alpha-taxonomical work in Oxyporinae globally. The revision revealed 10 species of Oxyporus in the fauna of the Russian Federation; eliminated erroneous species records; established two new synonyms, Oxyporus (Oxyporus) basicornis Cameron, 1930 = O. (O.) aequicollis Bernhauer, 1935, syn.nov. = O. (O.) parvus Lee et al., 2020, syn. nov.; and raised the hypothesis that O. (O.) aokii Dvořák, 1956, O. (O.) basiventris Jarrige, 1948 and O. (O.) kobayashii Hayashi, 2015 are conspecific with O. (O.) maxillosus Fabricius, 1793. Lectotypes are designated for O. (O.) basicornis Cameron, 1930, O. (O.) germanus Sharp, 1889, O. (O.) niger Sharp, 1889, and O. (O.) triangulus Sharp, 1889. Comprehensive taxonomic treatment and an identification key are provided for all species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».