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Enregistrement W3168572596 · doi:10.1016/j.ajhg.2021.05.017

Pan-ancestry exome-wide association analyses of COVID-19 outcomes in 586,157 individuals

2021· article· en· W3168572596 sur OpenAlexaff
Jack A. Kosmicki, Julie Horowitz, Nilanjana Banerjee, Rouel Lanche, Anthony Marcketta, Evan K. Maxwell, Xiaodong Bai, Dylan Sun, Joshua Backman, Deepika Sharma, Fabrício S. P. Kury, Hyun Min Kang, Colm O’Dushlaine, Ashish Yadav, Adam J. Mansfield, Alexander Li, Kyoko Watanabe, Lauren Gurski, Shane McCarthy, Adam E. Locke, Shareef Khalid, Sean O’Keeffe, Joelle Mbatchou, Olympe Chazara, Yunfeng Huang, Erika Kvikstad, Amanda O’Neill, Paul Nioi, Meg M. Parker, Slavé Petrovski, Heiko Runz, Joseph D. Szustakowski, Quanli Wang, Emily Wong, Aldo Córdova‐Palomera, Erin N. Smith, Sándor Szalma, Xiuwen Zheng, Sahar Esmaeeli, J. Wade Davis, Yi-Pin Lai, Xing Chen, Anne E. Justice, Joseph B. Leader, Tooraj Mirshahi, David J. Carey, Anurag Verma, Giorgio Sirugo, Marylyn D. Ritchie, Daniel J. Rader, Gundula Povysil, David B. Goldstein, Krzysztof Kiryluk, Erola Pairo‐Castineira, Konrad Rawlik, Dorota Pasko, Susan Walker, Alison Meynert, Athanasios Kousathanas, Loukas Moutsianas, Albert Tenesa, Mark J. Caulfield, Richard H. Scott, James F. Wilson, J. Kenneth Baillie, Guillaume Butler‐Laporte, Tomoko Nakanishi, Mark Lathrop, J. Brent Richards, Marcus B. Jones, Suganthi Balasubramanian, William Salerno, Alan R. Shuldiner, Jonathan Marchini, John D. Overton, Lukas Habegger, Michael Cantor, Jeffrey G. Reid, Aris Baras, Gonçalo R. Abecasis, Manuel A. R. Ferreira

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchAbbVie
Mots-clésExomeExome sequencingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiologyGeneGeneticsGenetic associationDiseaseSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineSingle-nucleotide polymorphismGenotypeInfectious disease (medical specialty)MutationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,452
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations97
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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