Systems‐Based Analysis of the Pancreatic Cancer‐Specific Glycome Reveals ST6GAL1 as a Driver of Human and Murine Disease
Notice bibliographique
Résumé
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA) is the 3 rd leading cause of cancer‐death in the U.S.. Glycans, such as CA‐19‐9, are biomarkers of PDA, but their roles in PDA biology are unclear. Herein, we utilized lectin microarray technology to compare the glycomes of human and murine PDA. We observed common aberrant patterns of glycosylation across both species, including increased levels of α‐2,3‐ and α‐2,6‐sialic acids, bisecting GlcNAc and poly‐LacNAc. Using single cell sequencing and histological data, we identified ST6GAL1, which underlies α‐2,6‐sialic acid, as a potential driver in human PDA. We created a novel mouse in which a pancreas‐specific genetic deletion of ST6GAL1 overlays the well‐established KC mouse model. Analysis of our model showed delayed cancer formation and a significant reduction in fibrosis. Our results highlight the utility of the KC model as an accurate reflection of human disease and identify ST6GAL1 as a key driver of pancreatic cancer initiation and progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».