MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3168879775 · doi:10.1101/2021.06.08.21258518

Immunity to SARS-CoV-2 persists 9 months post-symptoms with an altered T cell phenotype compared to influenza A virus-specific memory

2021· preprint· en· W3168879775 sur OpenAlexafffund
Jaclyn C. Law, Mélanie Girard, Gary Chao, Lesley A. Ward, Baweleta Isho, Bhavisha Rathod, Karen Colwill, Zhijie Li, James M. Rini, Feng Yun Yue, Samira Mubareka, Allison McGeer, Mario Ostrowski, Jennifer L. Gommerman, Anne‐Claude Gingras, Tania H. Watts

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreSinai Health SystemSt. Michael's HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCytotoxic T cellImmunologyCD8AntibodyCytokineT cellBiologyVirusPhenotypeMemory B cellImmune systemInfluenza A virusVirologyB cellGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SARS-CoV-2 induces T cell, B cell and antibody responses that are detected for several months in recovered individuals. Whether this response resembles a typical respiratory viral infection is a matter of debate. Here we followed T cell and antibody responses in 24 mainly non-hospitalized SARS-CoV-2 recovered subjects at two time points (median of 45- and 145-days post-symptom onset). Antibody responses were detected in 95% of subjects, with a strong correlation between plasma and salivary anti-S and anti-RBD IgG, as well as a correlation between circulating T follicular helper cells and the SARS-CoV-2-specific IgG response. Based on intracellular cytokine production or proliferation, CD4 + T cell responses to SARS-CoV-2 were detected in all subjects, decaying with a half-life of 5-6 months for S-specific IL-2-producing cells. CD4 + responses were largely of the T helper 1 phenotype, but with a lower ratio of IFN-γ: IL-2 producing cells and a lower frequency of CD8 +: CD4 + T cells compared to influenza A virus-(IAV)-specific memory responses within the same subjects. Analysis of secreted molecules also revealed a lower ratio of IFN-γ: IL-2 and IFN-γ: IL-6 and an altered cytotoxic profile for S- and N-specific compared to IAV-specific responses. These data suggest that the memory T-cell phenotype after a single infection with SARS-CoV-2 persists over time, with an altered cytokine and cytotoxic profile compared to long term memory to IAV within the same subjects. One Sentence Summary Immunity to SARS-CoV-2 in a cohort of patients, mainly with mild COVID-19 disease, persists to 9 months with an altered T cell cytokine and cytotoxicity profile compared to influenza A virus-specific memory T cells from the same subjects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxiv→Même sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 Research→Travaux en français237 207→