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Enregistrement W3168964327 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.1018.2

The Basis of the Substrate Specificity of the Epsilon Isoform of Human Diacylglycerol Kinase is not a Consequence of Competing Hydrolysis of ATP

2013· article· en· W3168964327 sur OpenAlexaffabout
Richard M. Epand, Aaron Prodeus, Bob Berno, Matthew K. Topham

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiacylglycerol kinaseGlycerol kinaseBiochemistrySubstrate (aquarium)PhosphorylationProtein kinase CChemistrySecond messenger systemKinaseSubstrate-level phosphorylationEnzymeAdenosine triphosphatePhosphateBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diacylglycerol kinase from E. coli transfers some of the γ‐phosphate of ATP to water as well as to diacylglycerol. We also demonstrate that glycerol can act as an acceptor for the phosphate of ATP. We have compared this behavior with that of the only mammalian isoform of diacylglycerol kinase that exhibits acyl chain specificity, i.e. DGKε. The purpose of the study was to determine if differences in the competition between ATPase activity and lipid phosphorylation could contribute to the observed acyl chain specificity with different diacylglycerols. Neither with the highly specific substrate of DGKε, 1‐stearoyl‐2‐arachidonoyl glycerol, nor with a less specific substrate, 1‐stearoyl‐2‐linoleoyl glycerol, is there any evidence for ATP hydrolysis accompanying substrate phosphorylation. Thus, at least for this isoform of diacylglycerol kinase, water does not compete with diacylglycerol as an acceptor of the γ‐phosphate of ATP. The results demonstrate that the substrate specificity of mammalian DGKε is not a consequence of different degrees of ATP hydrolysis in the presence of different species of diacylglycerol. This work was supported by a grant from the Natural Sciences and Engineering Council of Canada, 9848.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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