MOLECULAR DOCKING ANALYSIS OF Azadirachta indica CONSTITUENTS AS INHIBITORS OF AFLATOXIN POLYKETIDE SYNTHASE (APKS)
Notice bibliographique
Résumé
In the present study, 18 selected Azadirachta indica constituents, which includes azadiractin, azadiron, epicatechin, epoxyazadiradione, gallic acid, gedunin, isomargolonone, kaempferol, mahmoodin, margolone, margolonone, myristinin A, nimbolide, nimocinolide, quercetin, quercitrin, rutin and sugiol were assessed on the docking behaviour of Aflatoxin polyketide synthase (APKS) by utilizing PatchDock method. Furthermore, Molecular physico-chemical, Bioactivity scores and Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion (ADME) analyses were also carried out using Molinspiration and Swiss ADME respectively. The molecular Physico-chemical analysis predicted that rutin has shown three violations for Lipinski's rule of five. And whereas, ADME analysis also showed to have high gastro-intestinal (GI) absorption effect for all the ligands (except for azadiractin, quercetin, quercitin and rutin). The docking studies revealed that myristinin A showed the best binding energy (-350.92 kcal/mol) for the target enzyme Aflatoxin polyketide synthase (APKS). Thus the present findings provide new insights in understanding 18 Azadirachta indica constituents as a possible inhibitor against PKS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».