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Enregistrement W3168986365 · doi:10.31788/rjc.2021.1426063

MOLECULAR DOCKING ANALYSIS OF Azadirachta indica CONSTITUENTS AS INHIBITORS OF AFLATOXIN POLYKETIDE SYNTHASE (APKS)

2021· article· en· W3168986365 sur OpenAlexaff
Solomon Abrehame, Merry Hailu, Valsa Remony Manoj, Yen‐Po Chen, Radhakrishnan Narayanaswamy

Notice bibliographique

RevueRASAYAN Journal of Chemistry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiens123 Certification (Canada)
Organismes subventionnairesInstitute on the Environment, University of MinnesotaMinistry of Education, India
Mots-clésAflatoxinAzadirachtaDocking (animal)ChemistryPolyketide synthaseEnzymeStereochemistryBiochemistryPolyketideBiologyFood scienceBotanyMedicineBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the present study, 18 selected Azadirachta indica constituents, which includes azadiractin, azadiron, epicatechin, epoxyazadiradione, gallic acid, gedunin, isomargolonone, kaempferol, mahmoodin, margolone, margolonone, myristinin A, nimbolide, nimocinolide, quercetin, quercitrin, rutin and sugiol were assessed on the docking behaviour of Aflatoxin polyketide synthase (APKS) by utilizing PatchDock method. Furthermore, Molecular physico-chemical, Bioactivity scores and Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion (ADME) analyses were also carried out using Molinspiration and Swiss ADME respectively. The molecular Physico-chemical analysis predicted that rutin has shown three violations for Lipinski's rule of five. And whereas, ADME analysis also showed to have high gastro-intestinal (GI) absorption effect for all the ligands (except for azadiractin, quercetin, quercitin and rutin). The docking studies revealed that myristinin A showed the best binding energy (-350.92 kcal/mol) for the target enzyme Aflatoxin polyketide synthase (APKS). Thus the present findings provide new insights in understanding 18 Azadirachta indica constituents as a possible inhibitor against PKS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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