MOLECULAR DOCKING ANALYSIS OF Azadirachta indica CONSTITUENTS AS INHIBITORS OF AFLATOXIN POLYKETIDE SYNTHASE (APKS)
Notice bibliographique
Résumé
In the present study, 18 selected Azadirachta indica constituents, which includes azadiractin, azadiron, epicatechin, epoxyazadiradione, gallic acid, gedunin, isomargolonone, kaempferol, mahmoodin, margolone, margolonone, myristinin A, nimbolide, nimocinolide, quercetin, quercitrin, rutin and sugiol were assessed on the docking behaviour of Aflatoxin polyketide synthase (APKS) by utilizing PatchDock method.Furthermore, Molecular physico-chemical, Bioactivity scores and Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion (ADME) analyses were also carried out using Molinspiration and Swiss ADME respectively.The molecular Physico-chemical analysis predicted that rutin has shown three violations for Lipinski's rule of five.And whereas, ADME analysis also showed to have high gastro-intestinal (GI) absorption effect for all the ligands (except for azadiractin, quercetin, quercitin and rutin).The docking studies revealed that myristinin A showed the best binding energy (-350.92kcal/mol) for the target enzyme Aflatoxin polyketide synthase (APKS).Thus the present findings provide new insights in understanding 18 Azadirachta indica constituents as a possible inhibitor against PKS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».