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Enregistrement W3169017175 · doi:10.4049/jimmunol.2001451

Genetic, Immunological, and Clinical Features of 32 Patients with Autosomal Recessive STAT1 Deficiency

2021· letter· en· W3169017175 sur OpenAlexaff
Tom Le Voyer, Sonoko Sakata, Miyuki Tsumura, Taushif Khan, Ana Esteve‐Solé, Bandar Al‐Saud, Hatice Eke Güngör, Prasad Taur, Valentine Jeanne-Julien, Mette Christiansen, Lisa-Maria Köhler, Gehad ElGhazali, Jérémie Rosain, Shiho Nishimura, Fumiaki Sakura, Matthieu Bouaziz, Carmen Oleaga‐Quintas, Alejandro Nieto-Patlán, Àngela Deyà‐Martínez, Yasemin Altuner Torun, Anna‐Lena Neehus, Manon Roynard, Şefika Elmas Bozdemir, Nawal Al Kaabi, Moza Al Hassani, Irina Mersiyanova, Flore Rozenberg, Carsten Speckmann, Ina Hainmann, Fabian Hauck, Mohammed H. Al-Zahrani, Sami Al-Hajjar, Saleh Al‐Muhsen, Theresa Cole, Ramsay Fuleihan, Peter D. Arkwright, Raffaele Badolato, Laia Alsina, Laurent Abel, Mukesh Desai, Hamoud Al‐Mousa, Anna Shcherbina, Nico Marr, Stéphanie Boisson‐Dupuis, Jean‐Laurent Casanova, Satoshi Okada, Jacinta Bustamante

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthJapan Society for the Promotion of ScienceHoward Hughes Medical InstituteMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyAgence Nationale de la RechercheSt. Giles FoundationInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésGeneticsBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autosomal recessive (AR) STAT1 deficiency is a severe inborn error of immunity disrupting cellular responses to type I, II, and III IFNs, and IL-27, and conferring a predisposition to both viral and mycobacterial infections. We report the genetic, immunological, and clinical features of an international cohort of 32 patients from 20 kindreds: 24 patients with complete deficiency, and 8 patients with partial deficiency. Twenty-four patients suffered from mycobacterial disease (bacillus Calmette–Guérin = 13, environmental mycobacteria = 10, or both in 1 patient). Fifty-four severe viral episodes occurred in sixteen patients, mainly caused by Herpesviridae viruses. Attenuated live measles, mumps, and rubella and/or varicella zoster virus vaccines triggered severe reactions in the five patients with complete deficiency who were vaccinated. Seven patients developed features of hemophagocytic syndrome. Twenty-one patients died, and death was almost twice as likely in patients with complete STAT1 deficiency than in those with partial STAT1 deficiency. All but one of the eight survivors with AR complete deficiency underwent hematopoietic stem cell transplantation. Overall survival after hematopoietic stem cell transplantation was 64%. A diagnosis of AR STAT1 deficiency should be considered in children with mycobacterial and/or viral infectious diseases. It is important to distinguish between complete and partial forms of AR STAT1 deficiency, as their clinical outcome and management differ significantly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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