Predicting Anthracycline‐induced Cardiotoxicity in Children – Genome‐Wide Association Study
Notice bibliographique
Résumé
Identified genetic markers for anthracycline‐induced cardiotoxicity (ACT) explain only a small fraction of the variability of this phenotype, suggesting the presence of other, as‐of‐yet unidentified susceptibility loci. Therefore, our goal is to identify additional genetic markers with large effect size via genome‐wide association study (GWAS). Patients were recruited and clinically characterized (age at start of treatment, cumulative dose, gender, anthracycline and tumor type, radiation therapy involving the heart, follow‐up time and assessment of LV dysfunction) via the Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety. We have recruited and clinically characterized over 400 patients from across Canada to serve as our discovery cohort and over 120 patients from the Emma Children's Hospital in Amsterdam, the Netherlands, to be used as our replication cohort. More patients are currently being recruited and the clinical characterization is ongoing. We are now genotyping samples with an Illumina GWAS panel and the statistical analyses will be underway soon using SVS/Helix Tree, SPSS, Epi Info, PLINK and R. Novel genetic predictors for ACT may become essential for screening patients before the start of treatment, comprehensive risk assessment and management, and evidence‐based treatment decisions, monitoring and prevention. This work was supported by CIHR, CFRI, and Genome BC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».