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Enregistrement W3169300700 · doi:10.1101/2021.06.09.444962

Single-cell RNA sequencing uncovers the excitatory/inhibitory synaptic unbalance in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury

2021· preprint· en· W3169300700 sur OpenAlexaff
Jinghua Wang, Cheng Wu, Yan‐Na Lian, Ziyue Wang, Jiajun Dong, Qin Wu, Li Liu, Li Sun, Wei Chen, Wenjuan Chen, Zhi Zhang, Min Zhuo, Xiang‐Yao Li

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePain Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesZhejiang UniversityFundamental Research Funds for the Central UniversitiesMinistry of Education, IndiaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésNeuroscienceNerve injuryPeripheral nerve injuryInhibitory postsynaptic potentialNeuropathic painNeurotransmissionRetrosplenial cortexExcitatory postsynaptic potentialChemistryMedicineBiologyAnesthesiaInternal medicineCortex (anatomy)ReceptorSciatic nerve

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nerve injury in the somatosensory pathway may induce maladaptive changes at the transcriptional or protein level, contributing to the development and maintenance of neuropathic pain. In contrast to the retrosplenial cortex (RSC), which processes nociceptive information and exhibits structural and molecular changes after nerve injury, detailed transcriptional changes in the RSC are not yet known. Here we confirm the involvement of the RSC in regulating pain sensation and observe that the same peripheral stimulation activates more retrosplenial neurons after nerve injury; reducing the activities of CaMKII α + splenial cells relieves peripheral pain hypersensitivity after nerve injury. Using a single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) approach, we identified cell-type-specific gene expression changes after nerve injury, and the gene set enrichment analysis results revealed suppressed ion homeostasis in CaMKII α + neurons. Furthermore, examination of the expression of genes encoding ligand-gated ion channels showed a decrease in Gabar1a but an increase in Gria1 in CaMKII α + neurons; consistently, we confirmed the unbalanced excitatory/inhibitory synaptic transmission by using the electrophysiological recording approach. Moreover, micro-infusion of 1-Naphthyl acetyl spermine in the RSC to reduce excitatory synaptic transmission alleviated peripheral pain hypersensitivity. Our data confirm the involvement of the RSC in pain regulation and provide information on cell type-dependent transcriptomic changes after nerve injury, which will contribute to the understanding of the mechanisms mediating neuropathic pain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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