Methylation Patterns in the 5’ Flanking Region of The Hoxb9 Gene in Sea Turtle Embryos with Congenital Malformations
Notice bibliographique
Résumé
Sea turtles are wild animals whose embryonic development largely depends on environmental factors. The shell of sea turtles is a novelty among vertebrates and follows a Hox code and axial formula for the group. The hoxb9 gene is a transcription factor involved in the regulation of embryonic development, mainly during neural tube development and plays an important role in shaping the thoracic-lumbar transition of sea turtles. Although it is known that Hox genes are regulated by chromatin modulating proteins, DNA methylation in CpG islands may also contribute to gene regulation. Previous studies have shown a high prevalence of congenital malformations in the olive ridley sea turtle (Lepidochelys olivacea), including Schistosomus Reflexus (SR) syndrome. Here we studied the methylation profiles in the 5’ flanking region of hoxb9 comparing normal and abnormal sea turtle embryos. Our results indicate that methylation of the putative promoter region of hoxb9 in sea turtle embryos occurred, however methylated cytosines showed individual patterns, not directly related to the development of congenital malformations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».