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Enregistrement W3170062184 · doi:10.1053/j.gastro.2021.06.025

Interferon-Gamma–Producing CD8+ Tissue Resident Memory T Cells Are a Targetable Hallmark of Immune Checkpoint Inhibitor–Colitis

2021· article· en· W3170062184 sur OpenAlexfundno aff
Sarah C. Sasson, Stephanie Slevin, Vincent Cheung, Isar Nassiri, Anna Olsson‐Brown, Eve Fryer, Ricardo C. Ferreira, Dominik Trzupek, Tarun Gupta, Lulia Al‐Hillawi, Mari-lenna Issaias, Alistair Easton, Leticia Campo, Michael Fitzpatrick, Joss Adams, Meenali Chitnis, Andrew Protheroe, Mark Tuthill, Nicholas Coupe, Alison Simmons, Miranda Payne, Mark R. Middleton, Simon Travis, Benjamin P. Fairfax, Paul Klenerman, Oliver Brain

Notice bibliographique

RevueGastroenterology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilPfizer CanadaNational Institutes of HealthNorman Collisson FoundationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBritish Microcirculation SocietyNational Institute for Health and Care ResearchNIHR Bristol Biomedical Research CentreJuvenile Diabetes Research Foundation United States of AmericaWellcome TrustJuvenile Diabetes Research Foundation United Kingdom
Mots-clésColitisCD8Immune systemInterferon gammaCancer researchCytotoxic T cellMedicineImmunologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background & Aims The pathogenesis of immune checkpoint inhibitor (ICI)–colitis remains incompletely understood. We sought to identify key cellular drivers of ICI-colitis and their similarities to idiopathic ulcerative colitis, and to determine potential novel therapeutic targets. Methods We used a cross-sectional approach to study patients with ICI-colitis, those receiving ICI without the development of colitis, idiopathic ulcerative colitis, and healthy controls. A subset of patients with ICI-colitis were studied longitudinally. We applied a range of methods, including multiparameter and spectral flow cytometry, spectral immunofluorescence microscopy, targeted gene panels, and bulk and single-cell RNA sequencing. Results We demonstrate CD8 + tissue resident memory T (T RM ) cells are the dominant activated T cell subset in ICI-colitis. The pattern of gastrointestinal immunopathology is distinct from ulcerative colitis at both the immune and epithelial-signaling levels. CD8 + T RM cell activation correlates with clinical and endoscopic ICI-colitis severity. Single-cell RNA sequencing analysis confirms activated CD8 + T RM cells express high levels of transcripts for checkpoint inhibitors and interferon-gamma in ICI-colitis. We demonstrate similar findings in both anti–CTLA-4/PD-1 combination therapy and in anti–PD-1 inhibitor-associated colitis. On the basis of our data, we successfully targeted this pathway in a patient with refractory ICI-colitis, using the JAK inhibitor tofacitinib. Conclusions Interferon gamma–producing CD8 + T RM cells are a pathological hallmark of ICI-colitis and a novel target for therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations204
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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