Brine chemistry matters: Isolation by environment and by distance explain population genetic structure of<i>Artemia franciscana</i>in saline lakes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The American brine shrimp Artemia franciscana is important in aquaculture and has become invasive in other continents, aided by dispersal via waterbirds. However, little is known about processes underlying its genetic diversity and population structure in its natural habitat in North America. These processes, including dispersal and local adaptation, are pivotal drivers of species distribution and community structure, and therefore central to aquatic biodiversity. We studied 15 populations in natural saline lakes of Saskatchewan, Canada to determine the influence of variation in geological history, water chemistry, lake size, and location. We aimed to determine the relative importance of isolation by distance and isolation by environment using the cytochrome c oxidase subunit 1 gene (CO1) as a mitochondrial marker and five nuclear microsatellite markers. Geographic patterns for CO1 and microsatellites differed, with lakes clustering in different groups based on genetic distances according to the marker used. CO1 better indicated historical colonisation processes, suggesting potential routes of initial colonisation when lakes were formed after deglaciation 11,000–15,000 years ago. Differentiation between lakes based on nuclear markers was strongly related to variation in hydrochemistry, suggested by distance‐based redundancy analysis, but there was no indication of isolation by distance. The ratio between alkalinity and the sum of Ca and Mg concentrations was particularly important, although a lake with a high Cl concentration caused by potash mining also had a unique Artemia population. Geochemistry is important in the adaptive radiation of anostracan crustaceans. Our study suggests that it also underlies intraspecific genetic variation between populations, promoting isolation by environment, and making dispersal ineffective when cysts are moved by birds between lakes with different hydrochemistry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».