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Enregistrement W3170352280 · doi:10.1107/s1600577521004355

BL-11C Micro-MX: a high-flux microfocus macromolecular-crystallography beamline for micrometre-sized protein crystals at Pohang Light Source II

2021· article· en· W3170352280 sur OpenAlexfundno aff
Do-Heon Gu, Cheolsoo Eo, Seung-A Hwangbo, S.C. Ha, Jin Hong Kim, Hyoyun Kim, Chae-Soon Lee, In Deuk Seo, Young Duck Yun, Woulwoo Lee, Hyeongju Choi, Jangwoo Kim, Jun Lim, Seungyu Rah, Jeong‐Sun Kim, Jie‐Oh Lee, Yeon‐Gil Kim, Suk‐Youl Park

Notice bibliographique

RevueJournal of Synchrotron Radiation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Research Foundation of KoreaMinistry of Science, ICT and Future PlanningNational Research FoundationCanadian Light Source
Mots-clésBeamlineUndulatorSynchrotronMonochromatorDiffractometerProtein crystallizationOpticsMaterials scienceGoniometerSynchrotron radiationCrystallographyBeam (structure)PhysicsChemistryCrystal structureWavelengthCrystallization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BL-11C, a new protein crystallography beamline, is an in-vacuum undulator-based microfocus beamline used for macromolecular crystallography at the Pohang Accelerator Laboratory and it was made available to users in June 2017. The beamline is energy tunable in the range 5.0–20 keV to support conventional single- and multi-wavelength anomalous-dispersion experiments against a wide range of heavy metals. At the standard working energy of 12.659 keV, the monochromated beam is focused to 4.1 µm (V) × 8.5 µm (H) full width at half-maximum at the sample position and the measured photon flux is 1.3 × 10 12 photons s −1 . The experimental station is equipped with a Pilatus3 6M detector, a micro-diffractometer (MD2S) incorporating a multi-axis goniometer, and a robotic sample exchanger (CATS) with a dewar capacity of 90 samples. This beamline is suitable for structural determination of weakly diffracting crystalline substances, such as biomaterials, including protein, nucleic acids and their complexes. In addition, serial crystallography experiments for determining crystal structures at room temperature are possible. Herein, the current beamline characteristics, technical information for users and some recent scientific highlights are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0520,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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