Regulation of Gene Expression by Short Poly‐N‐Acetyl Glucosamine (sNAG) Nanofibers in Endothelial Cells and Keratinocytes
Notice bibliographique
Résumé
O‐GlcNAcylation is a catalyzed transfer of N‐acetylglucosamine to protein substrates. This modification aids cells in regulation of many crucial cellular processes. Short poly poly‐N‐acetyl glucosamine nanofibers (sNAG) enhance wound healing, by cell migration, and hemostasis, by promoting fibrin matrix and clot formation. This study investigated the effects of sNAG on global gene expression using the SOLiD 5500xl Next generation sequencing system in both HUVEC (Human Umbilical Vein Endothelial Cells) and HaCaT (Human keratinocytes) focussing on those having roles in angiogenesis and wound healing. In HUVEC cells, 1,705 genes had at least 2‐fold up‐or down‐regulation upon sNAG treatment. Genes which remained up‐regulated at both 1 and 6 hours of treatment were NFKBIZ, defensins and wound heaIing responses. Many of the collagen family of proteins, E‐Selectin, ICAM1, and cytokines, CXCL1 and CCL2, were up‐regulated transiently. In HaCaT cells, 2,329 genes showed 2‐fold up regulation in response to sNAG (1 or 6 hours) and 2,487 genes showed 2‐fold down regulation. Genes that were up‐regulated over the 6 hour treatment include desmogleins and keratins, suggesting regulation of keratinocyte differentiation and re‐epithelialization. Responses to sNAG observed in this study add support to its role in angiogenesis and wound healing pathways at the level of regulation of gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».