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Enregistrement W3170721668 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.03159

Metal Substrate Selectivity and Mechanism of Transport in a Transmembrane Zn‐pump Revealed by <i>in‐vitro</i> Real‐time Transport

2021· article· en· W3170721668 sur OpenAlexfundno aff
Sameera Abeyrathna, Nisansala S. Abeyrathna, Gordon W. Irvine, Priyanka Basak, Gabriele Meloni

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésChemistryDivalentLipid bilayerATPaseBiophysicsVesicleBiochemistrySubstrate (aquarium)P-type ATPaseMetal ions in aqueous solutionMetalMembraneEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

P 1B ‐type ATPases are primary active transmembrane metal pumps conserved in all kingdoms of life that play a pivotal role in controlling cellular metal ion levels and homeostasis. In bacteria, they are responsible for selectively exporting essential and toxic metal ions across the cell membrane to maintain concentrations below toxic levels. They are critical virulence factors in pathogenic bacteria and allow selected microorganisms to survive in extreme metal‐rich environments. The P 1B‐2 ‐type Zn(II) ATPase pump subfamily possesses a wide promiscuity towards metal substrate translocation by plastic selection of Zn(II)/Cd(II)/Hg(II)/Pb(II) at their high‐affinity transmembrane metal binding site. Despite these substrates stimulate ATP‐hydrolysis, direct translocation of all these metals and their mechanism of transport remain to be demonstrated. In this work, we established a platform for purification and in‐vitro functional reconstitution in artificial phospholipid bilayer vesicles (proteoliposomes) of ZntA from Cupriavidus metallidurans to dissect the molecular mechanism of divalent metal ion translocation and substrate promiscuity towards first‐, second‐ and the third‐row transition metals. Metal‐dependent ATPase activity assays of Cm ΔZntA 166–794 in detergent micelles and proteoliposomes revealed stimulation of the ATPase activity by Pb(II), Zn(II), Cd(II) and Hg(II) substrates with the maximal velocities (V max ) following the order Pb(II) > Zn(II) > Cd(II) > Hg(II), confirming the successful functional reconstitution in lipid vesicles. By selecting and encapsulating divalent metal sensitive fluorescent probes in the proteoliposome lumen, we performed real‐time metal transport assays to reveal the ATP‐dependent translocation of Pb(II), Zn(II), Cd(II) and Hg(II) across the lipid bilayer, establishing that the translocation rates correlate to the order observed following ATP hydrolysis. Furthermore, to dissect the substrate transport mechanism, we encapsulated the pH sensitive fluorescent probe pyranine to demonstrated that, differently than other P‐type ATPases, translocation is not coupled to H + counter‐flux for all the M(II) substrates. By encapsulating the membrane potential sensitive fluorescent probe Oxonol‐VI we also revealed that, with all substrates, Zn‐pumps act as primary active electrogenic uniporters capable of generating a transmembrane potential. This work establishes a platform to dissect the mechanisms of translocation of various metal substrates in P‐type ATPases which is applicable to study other uncharacterized transporter families and to reveal the bioinorganic chemistry of metal ion transport at molecular level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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