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Enregistrement W3170750217 · doi:10.1002/leg3.103

Common bean (<scp><i>Phaseolus vulgaris</i></scp> L.) with increased cysteine and methionine concentration

2021· article· en· W3170750217 sur OpenAlexafffundabout
Rosa Cecilia Viscarra‐Torrico, Aga Pajak, Álvaro Soler Garzón, Bailing Zhang, Sudhakar Pandurangan, Marwan Diapari, Qijian Song, R. L. Conner, James D. House, Phillip N. Miklas, Anfu Hou, Frédéric Marsolais

Notice bibliographique

RevueLegume Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of ManitobaWestern University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésMethioninePhaseolusBiologyCysteineQuantitative trait locusAmino acidProtein qualityRecombinant DNAPopulationGenotypeInbred strainSingle-nucleotide polymorphismGermplasmBiochemistryHorticultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In common bean ( Phaseolus vulgaris L.), seed storage protein deficiency is associated with increased total cysteine and methionine concentration. The goal of this study was to generate germplasm lines that combine this characteristic with adaptation to short season conditions in Manitoba, Canada. A recombinant inbred line population was developed by crossing the storage protein deficient genotype, SMARC1N‐PN1 with the cultivar Morden003. Two lines, 2‐37 and 3‐84, with a stable protein profile over 2 years at two locations were identified. Like SMARC1N‐PN1, both lines had a significantly higher cysteine concentration than Morden003, by approximately 35%. Methionine levels were elevated by approximately 15%, while tryptophan levels were also increased by approximately 30%. Line 2‐37 had a significant increase in protein quality, as measured by in vitro protein digestibility corrected amino acid score, by approximately 40%, as compared with Morden003. The increased protein quality for this line is attributable to higher levels of total cysteine and methionine, while having an overall reduction in crude protein concentration. Line 2‐37 had a similar seed yield as SMARC1N‐PN1, with a maturity comparable to Morden003. The results of high‐density single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and quantitative trait locus analysis of recombinant inbred lines indicated that variation in cysteine concentration was determined by the phaseolin locus, while variation in methionine concentration was determined by both the phaseolin and lectin loci. SNP markers that track the introgression of phaseolin and lectin deficiency into the Morden003 background were identified and validated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,043

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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