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Enregistrement W3170804229 · doi:10.1038/s41598-021-91367-0

Rare CASP6N73T variant associated with hippocampal volume exhibits decreased proteolytic activity, synaptic transmission defect, and neurodegeneration

2021· article· en· W3170804229 sur OpenAlexafffund
Libin Zhou, Kwangsik Nho, Maria G. Haddad, Nicole Cherepacha, Agne Tubeleviciute-Aydin, Andy P. Tsai, Andrew J. Saykin, P. Jesper Sjöström, Andréa C. LeBlanc

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill UniversityMontreal General HospitalJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthFondation de l'Hôpital général juifU.S. National Library of MedicineNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICONational Institute of General Medical SciencesH. Lundbeck A/SJewish General HospitalEisaiU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyUniversities Space Research AssociationNorthern California Institute for Research and EducationIllinois Department of Public HealthRush UniversityServierCurePSPNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerBiogenBioClinicaMayo Foundation for Medical Education and ResearchF. Hoffmann-La RocheMayo ClinicUniversity of Southern CaliforniaBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationAlzheimer SocietyTranslational Genomics Research InstituteNovartis Pharmaceuticals CorporationArizona Department of Health ServicesMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchArizona Biomedical Research CommissionFoundation for the National Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale Diagnostics
Mots-clésNeurodegenerationBiologyHippocampal formationCognitive declineNeuroscienceMedicinePathologyDementia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Caspase-6 (Casp6) is implicated in Alzheimer disease (AD) cognitive impairment and pathology. Hippocampal atrophy is associated with cognitive impairment in AD. Here, a rare functional exonic missense CASP6 single nucleotide polymorphism (SNP), causing the substitution of asparagine with threonine at amino acid 73 in Casp6 (Casp6N73T), was associated with hippocampal subfield CA1 volume preservation. Compared to wild type Casp6 (Casp6WT), recombinant Casp6N73T altered Casp6 proteolysis of natural substrates Lamin A/C and α-Tubulin, but did not alter cleavage of the Ac-VEID-AFC Casp6 peptide substrate. Casp6N73T-transfected HEK293T cells showed elevated Casp6 mRNA levels similar to Casp6WT-transfected cells, but, in contrast to Casp6WT, did not accumulate active Casp6 subunits nor show increased Casp6 enzymatic activity. Electrophysiological and morphological assessments showed that Casp6N73T recombinant protein caused less neurofunctional damage and neurodegeneration in hippocampal CA1 pyramidal neurons than Casp6WT. Lastly, CASP6 mRNA levels were increased in several AD brain regions confirming the implication of Casp6 in AD. These studies suggest that the rare Casp6N73T variant may protect against hippocampal atrophy due to its altered catalysis of natural protein substrates and intracellular instability thus leading to less Casp6-mediated damage to neuronal structure and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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