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Enregistrement W3170872181 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.860.1

Nuclear import of RNA polymerase II requires the conserved GPN‐loop GTPase XAB1/GPN1

2010· article· en· W3170872181 sur OpenAlexaff
Andrée-Anne Lacombe, Diane Forget, Philippe Cloutier, Racha Al‐Khoury, Annie Bouchard, Mathieu Lavallée‐Adam, Celia Jerónimo, Jacques Archambault, Mathieu Blanchette, Benoit Coulombe

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMcGill University Health CentreMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRanCell biologyBiologyRNA polymerase IINuclear transportCytoplasmTranscription (linguistics)GTPaseCell nucleusMolecular biologyGeneGeneticsGene expressionPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past 3 decades, many efforts have been made to identify and characterize the factors that regulate the activity of RNA polymerase II (RNAPII), the enzyme that synthesizes all the mRNA and many small nuclear RNA in eukaryotes. Quite surprisingly, very little is known about the cell machinery that regulates the fate of RNAPII before or after transcription. In this study, we report that XAB1/GPN1, a member of a unique class of GTPases containing a conserved GPN‐loop, is involved in the biogenesis of RNAPII by regulating its nuclear import. XAB1/GPN1 is physically associated with RNAPII in the soluble cell fraction and is essential for cell growth. Accumulation of RNAPII in the cytoplasm of the cell was induced upon (i) depletion of XAB1/GPN1 by siRNA silencing, (ii) overexpression of a XAB1‐GFP dominant negative fusion protein, (iii) mutation of the GTP‐binding or GPN motifs of the XAB1/GPN1 homologue in yeast, NPA3, and (iv) treatment of cells with leptomycin B, an inhibitor of XPO1/CRM1‐dependent nuclear export. Yeast strains with mutations in the NPA3 gene showed hypersensitivity to benomyl, a specific inhibitor of microtubule assembly, suggesting a role for microtubules in RNAPII biogenesis. Together, these results indicate that XAB1/GPN1 shuttles between the cytoplasm and the nucleus to mediate nuclear import of RNAPII.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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